RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 HARSP12081 509 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 PHBP35232 272 aa26.5■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 IFT43Q96FT9 208 aa26.5■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 MT-ND3P03897 115 aa26.5■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 MMP10P09238 476 aa26.5■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 PYGBP11216 843 aa26.5■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 KRT76Q01546 638 aa26.5■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 TMEM143Q96AN5 459 aa26.5■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 CLPTM1LQ96KA5 538 aa26.5■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 MECRQ9BV79 373 aa26.5■■□□□ 1.83
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SENP3-201ENST00000321337 ABLIM1O14639 778 aa26.49■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 DHRS4L1P0CG22 281 aa26.49■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 NEK3P51956 506 aa26.49■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 OCRLQ01968 901 aa26.49■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 CES4AQ5XG92 561 aa26.49■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 TREML1Q86YW5 311 aa26.49■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa26.49■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa26.49■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 PTK7Q13308 1070 aa26.49■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 FAM71DQ8N9W8 422 aa26.49■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 AVILO75366 819 aa26.48■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 RARBP10826 455 aa26.48■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 SFNP31947 248 aa26.48■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 KLHL38Q2WGJ6 581 aa26.48■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa26.48■■□□□ 1.83
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SENP3-201ENST00000321337 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 SYNCQ9H7C4 482 aa26.48■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 PPCSQ9HAB8 311 aa26.48■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 PXMP2Q9NR77 195 aa26.48■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 TMOD2Q9NZR1 351 aa26.48■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 CNTN6Q9UQ52 1028 aa26.48■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 DNAJC6O75061 913 aa26.48■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 ELK3P41970 407 aa26.48■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 TAF5Q15542 800 aa26.48■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 MTERF2Q49AM1 385 aa26.48■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 LRRC38Q5VT99 294 aa26.48■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 SH2D5Q6ZV89 423 aa26.48■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 MCF2L2Q86YR7 1114 aa26.48■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 CCNJLQ8IV13 435 aa26.48■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 FAM151AQ8WW52 585 aa26.48■■□□□ 1.83
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SENP3-201ENST00000321337 TFAP2BQ92481 460 aa26.47■■□□□ 1.83
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SENP3-201ENST00000321337 E7ESA3 106 aa26.47■■□□□ 1.83
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SENP3-201ENST00000321337 PGM1P36871 562 aa26.47■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 RAB27AP51159 221 aa26.47■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 NCOA4Q13772 614 aa26.47■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 GPAT2Q6NUI2 795 aa26.47■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 FAM161BQ96MY7 647 aa26.47■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa26.46■■□□□ 1.83
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SENP3-201ENST00000321337 ZNF132P52740 706 aa26.46■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 CACNA2D1P54289 1103 aa26.46■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 ARHGEF16Q5VV41 709 aa26.46■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 RSAD2Q8WXG1 361 aa26.46■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa26.46■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 H3BRJ5 948 aa26.46■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 ENO1P06733 434 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 AP1B1Q10567 949 aa26.46■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 CIAPIN1Q6FI81 312 aa26.46■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 WNK4Q96J92 1243 aa26.46■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 CNTN3Q9P232 1028 aa26.46■■□□□ 1.83
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SENP3-201ENST00000321337 B2RBV5 119 aa26.45■■□□□ 1.83
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SENP3-201ENST00000321337 SKIP12755 728 aa26.45■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 CHRNA5P30532 468 aa26.45■■□□□ 1.83
SENP3-201ENST00000321337 PTPN7P35236 360 aa26.45■■□□□ 1.83
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SENP3-201ENST00000321337 EMC1Q8N766 993 aa26.45■■□□□ 1.83
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SENP3-201ENST00000321337 C17orf75Q9HAS0 396 aa26.45■■□□□ 1.83
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SENP3-201ENST00000321337 TTLL13PA6NNM8 815 aa26.45■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 SERPINB4P48594 390 aa26.45■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 PRKCEQ02156 737 aa26.45■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 CCDC62Q6P9F0 684 aa26.45■■□□□ 1.82
SENP3-201ENST00000321337 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.82
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