RNA–Protein interactions for RNA: YKR093W

PTR2, Transcript of Integral membrane peptide transporter, yeastyeast

Gene PTR2, Length 1,806 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTR2YKR093W PAC10P48363 199 aa3.7□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W ERV14P53173 138 aa3.7□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W CSN9Q03981 162 aa3.7□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W FYV12Q08559 129 aa3.7□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W APC1P53886 1748 aa3.7□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W TIR1P10863 254 aa3.7□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W RPL30P14120 105 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W CYC2P38909 366 aa3.7□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W BOL2P53082 120 aa3.7□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W HHO1P53551 258 aa3.7□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W GSP1P32835 219 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W GSP2P32836 220 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W ERV15P38312 142 aa3.69□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W DLS1P40366 167 aa3.69□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W YJL144WP47009 104 aa3.69□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W YGR042WP53227 271 aa3.69□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W YCL001W-AP87012 153 aa3.69□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W MRPS8Q03799 155 aa3.69□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W TY4B-HP0C2J7 1802 aa3.69□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W TY4B-JP47024 1803 aa3.69□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W RPL22BP56628 122 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W HHT1P61830 136 aa3.68□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W AIM36Q03798 255 aa3.68□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W RFU1Q08003 200 aa3.68□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W PRM7Q12459 698 aa3.68□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W MRPL44P19956 98 aa3.67□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W STP22P25604 385 aa3.67□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data3.67□□□□□ -1.82not detected
PTR2YKR093W YGL204CP53089 101 aa3.67□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W DIG2Q03373 323 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W RAV2Q03956 351 aa3.67□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W YDR278CQ05612 105 aa3.67□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W FYV7Q12247 151 aa3.67□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W MED11Q99278 115 aa3.67□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W YGR201CP42936 225 aa3.67□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W PEX4P29340 183 aa3.66□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W NSA2P40078 261 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W YJR015WP47090 510 aa3.66□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W YMR295CQ03559 197 aa3.66□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W SCP1Q08873 200 aa3.66□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W ATP20Q12233 115 aa3.66□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W MRPL15P36523 253 aa3.65□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W SPC25P40014 221 aa3.65□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W CUP9P41817 306 aa3.65□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W SNN1P48232 102 aa3.65□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W YMR320WQ04897 101 aa3.65□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W ATG40Q99325 256 aa3.65□□□□□ -1.82
PTR2YKR093W ATP5P09457 212 aa3.65□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W FZF1P32805 299 aa3.65□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W CLB6P32943 380 aa3.65□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W YBR013CP38215 129 aa3.65□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W PHO88P38264 188 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W NSE4P43124 402 aa3.65□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W FIP1P45976 327 aa3.65□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W SBH1P52870 82 aa3.65□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W TIM13P53299 105 aa3.65□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W YGL194C-AQ2V2P6 80 aa3.65□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W YRF1-1P0CX20 1796 aa3.64□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W YRF1-5P0CX21 1796 aa3.64□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W YRF1-8P0CX22 1796 aa3.64□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W YOR062CP36025 268 aa3.64□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W GLR1P41921 483 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W YFR054CP43622 192 aa3.64□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W YMR253CQ04835 414 aa3.64□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W SPC3Q12133 184 aa3.64□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W EMC6Q12431 108 aa3.64□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W Q0144Q9ZZW2 109 aa3.64□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W SCL1P21243 252 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W RPS1BP23248 255 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W RPS1AP33442 255 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W SSS1P35179 80 aa3.63□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W YBR220CP38318 560 aa3.63□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W SHH3Q04487 196 aa3.63□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W SEN15Q04675 128 aa3.63□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W PCC1Q3E833 88 aa3.63□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W RIB3Q99258 208 aa3.63□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W UBR1P19812 1950 aa3.63□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W SRB6P32570 121 aa3.63□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W PAM17P36147 197 aa3.63□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W YNL217WP40152 326 aa3.63□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W YPR096CO13587 100 aa3.62□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W PHO85P17157 305 aa3.62□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W VPS28Q02767 242 aa3.62□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W LDB18Q07887 179 aa3.62□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W YLR422WQ06409 1932 aa3.61□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W PRE1P22141 198 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W IPT1P38954 527 aa3.61□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W YPL073CP40323 161 aa3.61□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W YAE1P47118 141 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W TVP18Q04767 167 aa3.61□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W IRC23Q08416 157 aa3.61□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W YLR236CA0A023PZG4 107 aa3.6□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W PRS3P38689 320 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W DAD3P69850 94 aa3.6□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W HRT1Q08273 121 aa3.6□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W FUN14P18411 198 aa3.6□□□□□ -1.83
PTR2YKR093W RRT1P38192 103 aa3.6□□□□□ -1.83
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