RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	SNF11	P38956	169 aa		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	GLE2	P40066	365 aa		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YFR020W	P43600	232 aa		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	SLG1	P54867	378 aa		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	HPA2	Q06592	156 aa		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YDL180W	Q12301	547 aa		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	BOL1	Q3E793	110 aa		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	STT4	P37297	1900 aa		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	RPB8	P20436	146 aa		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	SPO13	P23624	291 aa		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YPT10	P38146	199 aa		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	BXI1	P48558	297 aa		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	TPC1	P53257	314 aa		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YPL039W	Q03080	316 aa		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	SDC1	Q03323	175 aa		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YLR042C	Q07990	161 aa		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	COA2	Q3E823	68 aa		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	ERG4	P25340	473 aa		3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	VID24	P38263	362 aa		3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YGR164W	P53291	111 aa		3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	NCE103	P53615	221 aa		3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	COX12	Q01519	83 aa		3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	PIR3	Q03180	325 aa		3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YMR103C	Q04436	120 aa		3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YDR215C	Q12240	137 aa		3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	RNQ1	P25367	405 aa		3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	MIX17	Q03667	156 aa		3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	GEP3	Q08622	556 aa		3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YLR149C	Q99296	730 aa		3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	MDM35	O60200	86 aa		3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	PDE1	P22434	369 aa		3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YBL059W	P34224	193 aa		3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YNL195C	P40168	261 aa		3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	KNH1	P50112	268 aa		3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	BRP1	P53194	125 aa		3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	RXT3	Q07458	294 aa		3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	AYT1	Q12226	474 aa		3.06	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	TOM6	P33448	61 aa		3.05	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YKL044W	P36092	106 aa		3.05	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	PAM17	P36147	197 aa		3.05	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	ELO1	P39540	310 aa		3.05	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	CRH1	P53301	507 aa		3.05	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	RAF1	Q06891	181 aa		3.05	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.05	□□□□□ -1.92	not detected
XRS2	YDR369C	ECM15	P35195	104 aa		3.05	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	DSK2	P48510	373 aa		3.05	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	MMS2	P53152	137 aa		3.05	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YOR292C	Q08743	309 aa		3.05	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	RFM1	Q12192	310 aa		3.05	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		3.05	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		3.05	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		3.05	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	NRG2	P38082	220 aa		3.04	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	SVP26	P38869	228 aa		3.04	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	BRR6	P53062	197 aa		3.04	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.04	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	QCR9	P22289	66 aa		3.04	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YCR050C	P25630	102 aa		3.04	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	MRPS5	P33759	307 aa		3.04	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	ECM34	P38728	170 aa		3.04	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	MST28	P39552	234 aa		3.04	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YER181C	P40097	107 aa		3.04	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	BUD8	P41698	603 aa		3.04	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	SFT1	P43682	97 aa		3.04	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YGR219W	P53307	113 aa		3.04	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	MRX11	Q03079	207 aa		3.04	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YLR012C	Q07927	99 aa		3.04	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	FLO9	P39712	1322 aa		3.04	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	TRP1	P00912	224 aa		3.03	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	MDM10	P18409	493 aa		3.03	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	MLF3	P32047	452 aa		3.03	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	QRI5	P32344	111 aa		3.03	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	MTC7	P32633	139 aa		3.03	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	SAP30	P38429	201 aa		3.03	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YHL042W	P38729	150 aa		3.03	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	3.03	□□□□□ -1.92	RIP-Chip
XRS2	YDR369C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	DFG10	P40526	253 aa		3.03	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	TDA4	P47153	279 aa		3.03	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	HST4	P53688	370 aa		3.03	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	YHM2	Q04013	314 aa		3.03	□□□□□ -1.92
XRS2	YDR369C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.93

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