RNA–Protein interactions for RNA: YDL084W

SUB2, Transcript of Component of the TREX complex required for nuclear mRNA export, yeast

Gene SUB2, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SUB2	YDL084W	TOS2	P50078	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YPS5	P53057	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YGL034C	P53186	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	EST3	Q03096	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YBT1	P32386	1661 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	RIF1	P29539	1916 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	HEM4	P06174	275 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	MRS4	P23500	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YCR099C	P25657	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	CNE1	P27825	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	CSE2	P33308	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YIL054W	P40524	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	EAF6	P47128	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	UBP8	P50102	471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	SDS23	P53172	527 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YML079W	Q03629	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	SPG4	Q04438	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	GAT3	Q07928	141 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	ATG40	Q99325	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	MYO1	P08964	1928 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	UBC4	P15731	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	PAU16	P35994	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	MRPL39	P36533	70 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	CTP1	P38152	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	SVP26	P38869	228 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	EMC5	P40540	141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	DSK2	P48510	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	KNH1	P50112	268 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	SUT2	Q12286	268 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	AHT1	P29589	182 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	RPB7	P34087	171 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	SMP1	P38128	452 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	KEG1	P43614	200 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	UBC13	P52490	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YNL234W	P53857	426 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YMR252C	Q04814	134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	IRC25	Q07951	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	VMR1	P38735	1592 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	Q0255	P03881	472 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	DSS4	P32601	143 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	TOM6	P33448	61 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	MRPS9	P38120	278 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	ECM34	P38728	170 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	PAU5	P43575	122 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	SWS2	P53937	143 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	GPI19	Q04082	140 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	ECM29	P38737	1868 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
SUB2	YDL084W	GPI18	P38211	433 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	YGL193C	P53097	103 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	YGL088W	P53151	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	SUN4	P53616	420 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	YNL046W	P53956	172 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	ASM4	Q05166	528 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
SUB2	YDL084W	MSB2	P32334	1306 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	YIL169C	P40442	995 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
SUB2	YDL084W	GGC1	P38988	300 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	PEP8	P40335	379 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	TVP15	Q03860	143 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	MSA1	Q08471	629 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	DAD1	Q12248	94 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	CCH1	P50077	2039 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	YND1	P40009	630 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	MIC27	P50945	234 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	PEX2	P32800	271 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	YNL195C	P40168	261 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	BNS1	P50084	137 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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