RNA–Protein interactions for RNA: YOR217W

RFC1, Transcript of Subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C), yeast

Gene RFC1, Length 2,586 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RFC1	YOR217W	SPO73	P40031	143 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	YPS3	Q12303	508 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	ICT1	Q12385	394 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	APQ12	P40532	138 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	YPS6	P40583	537 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	GCV1	P48015	400 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	LOA1	Q06508	300 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	YOL159C	Q08300	171 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.44	□□□□□ -1.22	not detected
RFC1	YOR217W	CUP9	P41817	306 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	GON7	P46984	123 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	RIM15	P43565	1770 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	COX1	P00401	534 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	POP5	P28005	173 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	YIL024C	P40543	189 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	CAT5	P41735	233 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	SNO3	P43544	222 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	RRT5	P43607	289 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	SNO2	P53823	222 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	IZH2	Q12442	317 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	HUT1	Q12520	339 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	YCK3	P39962	524 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	UBX6	P47049	396 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	SBH1	P52870	82 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	PAI3	P01094	68 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	OPI3	P05375	206 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.43	□□□□□ -1.22	not detected
RFC1	YOR217W	YIL029C	P40538	142 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	DUG3	P53871	357 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	NAT3	Q06504	195 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	YPL162C	Q12042	273 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	7.43	□□□□□ -1.22	not detected
RFC1	YOR217W	ORT1	Q12375	292 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	COX13	P32799	129 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	GEP4	P38812	185 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	AIM11	P87275	137 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	CYT2	Q00873	224 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	YPQ1	Q12010	308 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	YDR029W	Q12111	104 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	SNF4	P12904	322 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	PEX34	P25584	144 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	ATG12	P38316	186 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	MST28	P39552	234 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	PAM16	P42949	149 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	SDC1	Q03323	175 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	SOR2	Q07786	357 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	TRX3	P25372	127 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	YAR029W	P39549	74 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	VMA21	P41806	77 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	FAR3	P46671	204 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	OST2	P46964	130 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	MSY1	P48527	492 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	YMR103C	Q04436	120 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	ACM1	Q08981	209 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	ERV29	P53337	310 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	TAZ1	Q06510	381 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	RCE1	Q03530	315 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	YMR317W	Q04893	1140 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	YLR126C	Q12288	251 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RFC1	YOR217W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.23
RFC1	YOR217W	YPL062W	Q02781	134 aa		7.4	□□□□□ -1.23
RFC1	YOR217W	YLR049C	Q12110	428 aa		7.4	□□□□□ -1.23
RFC1	YOR217W	YDL009C	Q12210	107 aa		7.4	□□□□□ -1.23
RFC1	YOR217W	IGO2	Q9P305	131 aa		7.4	□□□□□ -1.23
RFC1	YOR217W	YBR144C	P34215	104 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RFC1	YOR217W	YPL073C	P40323	161 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RFC1	YOR217W	UBP8	P50102	471 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RFC1	YOR217W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RFC1	YOR217W	YBR032W	P38223	100 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RFC1	YOR217W	VFA1	P40080	203 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RFC1	YOR217W	MOB2	P43563	287 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RFC1	YOR217W	HNT2	P49775	206 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RFC1	YOR217W	MCA1	Q08601	432 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RFC1	YOR217W	RIF1	P29539	1916 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RFC1	YOR217W	MSW1	P04803	379 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RFC1	YOR217W	MID1	P41821	548 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RFC1	YOR217W	ATP23	P53722	227 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RFC1	YOR217W	YHR139C-A	O13536	103 aa		7.38	□□□□□ -1.23

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