RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THP2	YHR167W	AIM36	Q03798	255 aa		2.6	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	GRX3	Q03835	250 aa		2.6	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	PEX10	Q05568	337 aa		2.6	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	YOL029C	Q08187	201 aa		2.6	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	FIT3	Q08907	204 aa		2.6	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	FEX1	Q08913	375 aa		2.6	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	FEX2	Q08991	375 aa		2.6	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	PRM4	Q12498	284 aa		2.6	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	FLO9	P39712	1322 aa		2.6	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	STT4	P37297	1900 aa		2.6	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	RPL39	P04650	51 aa		2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	SCO1	P23833	295 aa		2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	CLG1	P35190	452 aa		2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	GDS1	P41913	522 aa		2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	XPT1	P47165	209 aa		2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	SIP18	P50263	79 aa		2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	YGL159W	P53110	370 aa		2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	YGL114W	P53134	725 aa		2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	ATG41	Q12048	136 aa		2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	BBP1	Q12365	385 aa		2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	ATG40	Q99325	256 aa		2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	FMP27	Q06179	2628 aa		2.59	□□□□□ -1.99
THP2	YHR167W	SPS2	P08459	502 aa		2.58	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	GCN3	P14741	305 aa		2.58	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	URA6	P15700	204 aa		2.58	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	FMP23	P38231	175 aa		2.58	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	YBR242W	P38331	238 aa		2.58	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	VMA22	P38784	181 aa		2.58	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	ECM14	P38836	430 aa		2.58	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	CTR2	P38865	189 aa		2.58	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	YER084W	P40057	128 aa		2.58	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	AVT7	P40501	490 aa		2.58	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	YFL051C	P43552	160 aa		2.58	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	OTU1	P43558	301 aa		2.58	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	JAC1	P53193	184 aa		2.58	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	CAB5	Q03941	241 aa		2.58	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	YPR098C	Q06089	161 aa		2.58	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	YOR186W	Q08560	144 aa		2.58	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	RFM1	Q12192	310 aa		2.58	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	PET18	P25362	215 aa		2.57	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	ATG22	P25568	528 aa		2.57	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	FCY21	P40039	528 aa		2.57	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	PCL7	P40186	285 aa		2.57	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	OKP1	P53298	406 aa		2.57	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	VBA1	Q04301	562 aa		2.57	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	MED4	Q12343	284 aa		2.57	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	HUT1	Q12520	339 aa		2.57	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	COX10	P21592	462 aa		2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	YCL042W	P25572	119 aa		2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	KRE6	P32486	720 aa		2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	YKL187C	P34231	750 aa		2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	PRY2	P36110	329 aa		2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	POP8	P38208	133 aa		2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	SLM1	P40485	686 aa		2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	YKE4	P40544	346 aa		2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	YIR035C	P40579	254 aa		2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	YGL204C	P53089	101 aa		2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	HST4	P53688	370 aa		2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	MRPL50	P53724	139 aa		2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	SED1	Q01589	338 aa		2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	RNH1	Q04740	348 aa		2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	COA4	Q05809	96 aa		2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	CSI2	Q08054	341 aa		2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	PRM7	Q12459	698 aa		2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	YOS1	Q3E834	85 aa		2.56	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	VPS63	O13549	108 aa		2.55	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	COX9	P07255	59 aa		2.55	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	RPL43B	P0CX26	92 aa		2.55	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	IMP1	P28627	190 aa		2.55	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	MRP17	P28778	131 aa		2.55	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	SPT14	P32363	452 aa		2.55	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	MRPL3	P36516	390 aa		2.55	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	MBA1	P38300	278 aa		2.55	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	CUE1	P38428	203 aa		2.55	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	YHL044W	P38727	235 aa		2.55	□□□□□ -2
THP2	YHR167W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.55	□□□□□ -2	not detected

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