RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 RASSF10A6NK89 507 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 OCM2P0CE71 109 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 CACNB3P54284 484 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 NPEPPSP55786 919 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 ZNF484Q5JVG2 852 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 AGBL3Q8NEM8 1001 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 C1orf54Q8WWF1 131 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 CCDC134Q9H6E4 229 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 ERAP1Q9NZ08 941 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 AIPL1Q9NZN9 384 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 TUBE1Q9UJT0 475 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 FAM107AO95990 144 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 PGM1P36871 562 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 MMGT1Q8N4V1 131 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 FAM47DPA6NHR8 397 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 TOMM70O94826 608 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 TRIM49P0CI25 452 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 TRIM49CP0CI26 452 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 STAG3L1P0CL83 205 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 CNTFP26441 200 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 NFIXQ14938 502 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 MICALL2Q8IY33 904 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 DTX3LQ8TDB6 740 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 SEPT3Q9UH03 358 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 CARNS1A5YM72 827 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 KPNA6O60684 536 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 CCDC159P0C7I6 412 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 PRKCEQ02156 737 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 NR1I3Q14994 352 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 TTC30AQ86WT1 665 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 KSR1Q8IVT5 923 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 SNX31Q8N9S9 440 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 PDLIM2Q96JY6 352 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 SPON2Q9BUD6 331 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 GRID1Q9ULK0 1009 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 SUFUQ9UMX1 484 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 CPS1P31327 1500 aa7.55□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 RPS6KA5O75582 802 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 GSNP06396 782 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 PLD1Q13393 1074 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 PDK2Q15119 407 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 UNC45AQ9H3U1 944 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 RUBCNLQ9H714 662 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 NEU2Q9Y3R4 380 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 C17orf102A2RUQ5 167 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 FBXO21O94952 628 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 UCHL3P15374 230 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 PDGFRAP16234 1089 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 NMT1P30419 496 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 HARS2P49590 506 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 TP53BP2Q13625 1128 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 BBS7Q8IWZ6 715 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 SLC44A5Q8NCS7 719 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 TADA1Q96BN2 335 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 MCEEQ96PE7 176 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 MUC3BQ9H195 1237 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 ISCUQ9H1K1 167 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 EPC1Q9H2F5 836 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 ELP3Q9H9T3 547 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 BATF3Q9NR55 127 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 APPL1Q9UKG1 709 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 SUPT3HB4E1H0 165 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 CAMTA2O94983 1202 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 FGFR4P22455 802 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 TAF6P49848 677 aa7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 RAD23BP54727 409 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms