RNA–Protein interactions for RNA: YMR292W

GOT1, Transcript of Homodimeric protein that is packaged into COPII vesicles, yeast

Gene GOT1, Length 417 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GOT1	YMR292W	REC104	P33323	182 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	YUH1	P35127	236 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	LAG1	P38703	411 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	GPI16	P38875	610 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	LNP1	P38878	278 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	RMD6	P39975	231 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	XPT1	P47165	209 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	SNN1	P48232	102 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	PKP2	P53170	491 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	GPI15	P53961	229 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	HSK3	P69852	69 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	MEH1	Q02205	184 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	RIM9	Q04734	239 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	HOF1	Q05080	669 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	YOR292C	Q08743	309 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	FCY22	Q12119	530 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	YOR029W	Q12243	111 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	ATG5	Q12380	294 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	MEC1	P38111	2368 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	SPS4	P09937	338 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	CNB1	P25296	175 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	YKL162C	P36052	402 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	ERV15	P38312	142 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	YBR220C	P38318	560 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	CTR2	P38865	189 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	TOK1	P40310	691 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	PRM5	P40476	318 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	SLM1	P40485	686 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	EMC5	P40540	141 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	YFL015C	P43578	164 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	MCM22	P47167	239 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	CRZ1	P53968	678 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	ACS1	Q01574	713 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	SED1	Q01589	338 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	YML108W	Q03759	105 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	YMR082C	Q04276	118 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	UPS1	Q05776	175 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	USV1	Q12132	391 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	RFM1	Q12192	310 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	ISN1	Q99312	450 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	YML003W	P0CF16	290 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	SPS100	P13130	326 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	ZRC1	P20107	442 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	ELO2	P25358	347 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	DAL80	P26343	269 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	SIP1	P32578	815 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	YKL107W	P34251	309 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	FLO5	P38894	1075 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	YEA4	P40004	342 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	PCL7	P40186	285 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	YIL024C	P40543	189 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	YJR056C	P47115	236 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	SRB7	P47822	140 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	PEF1	P53238	335 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	CRH1	P53301	507 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	ALG12	P53730	551 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	WSC2	P53832	503 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	SNO1	Q03144	224 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	ADD37	Q03233	198 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	YFH1	Q07540	174 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	YOR015W	Q12169	119 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	COX17	Q12287	69 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	DGK1	Q12382	290 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	HBN1	Q96VH4	193 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	ROX3	P25046	220 aa		2.73	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	ERV1	P27882	189 aa		2.73	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	MSK1	P32048	576 aa		2.73	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	SRB6	P32570	121 aa		2.73	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	YKL187C	P34231	750 aa		2.73	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	UPS2	P35200	230 aa		2.73	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	SLM6	P38343	150 aa		2.73	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	ECM14	P38836	430 aa		2.73	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	IKI1	P38874	309 aa		2.73	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	CAF16	P43569	289 aa		2.73	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	PIR5	P46999	287 aa		2.73	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	BNA2	P47125	453 aa		2.73	□□□□□ -1.97
GOT1	YMR292W	GEP7	P53171	287 aa		2.73	□□□□□ -1.97

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