RNA–Protein interactions for RNA: YMR115W

MGR3, Transcript of Subunit of the mitochondrial (mt) i-AAA protease supercomplex, yeast

Gene MGR3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MGR3	YMR115W	GRE1	Q08969	168 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	TSC11	P40061	1430 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	YSP2	Q06681	1438 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	FES1	P38260	290 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	YJL144W	P47009	104 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	CAB4	P53332	305 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	LPP1	Q04396	274 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	YIL177C	P40434	1758 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	YJL225C	P40889	1758 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	ACP1	P32463	125 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	VMA11	P32842	164 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	SDH4	P37298	181 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	SHG1	P38337	142 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	RMD6	P39975	231 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	IRC22	P40006	225 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	COG3	P40094	801 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	YGR026W	P53217	278 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	YIP3	P53633	176 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	DID2	P69771	204 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	MDM32	Q12171	622 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	BUD3	P25558	1636 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MGR3	YMR115W	HAP1	P0CE41	1502 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	YOR1	P53049	1477 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	ATG22	P25568	528 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	PTM1	P32857	523 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	DSK2	P48510	373 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	GAS3	Q03655	524 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	YNG1	Q08465	219 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	MRPL28	P36527	147 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	YNL140C	P53910	189 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	PET191	Q02772	108 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	AKR2	Q12013	749 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	STU1	P38198	1513 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	VTH1	P40438	1549 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	VTH2	P40890	1549 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	CCA1	P21269	546 aa		2.69	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	TCA17	P32613	152 aa		2.69	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	CAF4	P36130	643 aa		2.69	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	SRP14	P38985	146 aa		2.69	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	AIM25	P47140	327 aa		2.69	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	SUE1	Q06524	206 aa		2.69	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	BCK1	Q01389	1478 aa		2.69	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	SSN2	P38931	1420 aa		2.69	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	PDR12	Q02785	1511 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	QCR2	P07257	368 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	YHL026C	P38740	315 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	YER121W	P40076	114 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	SNX4	P47057	423 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	YLR460C	P54007	376 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	YOL160W	Q08321	113 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	NUM1	Q00402	2748 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	CDC7	P06243	507 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	AME1	P38313	324 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	POP4	P38336	279 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	CTR2	P38865	189 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	YJR146W	P47174	117 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	RTC4	P53850	401 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	SLM2	P53955	656 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	SNO1	Q03144	224 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	MIX17	Q03667	156 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	MHT1	Q12525	324 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	MLP2	P40457	1679 aa		2.67	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	CDC8	P00572	216 aa		2.67	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	SKG1	P36169	355 aa		2.67	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	MED6	P38782	295 aa		2.67	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	RSM25	P40496	264 aa		2.67	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	YGR050C	P53231	118 aa		2.67	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	NRK1	P53915	240 aa		2.67	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	YPL162C	Q12042	273 aa		2.67	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	YPR117W	Q06116	2489 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	MSW1	P04803	379 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	PUT1	P09368	476 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	YLR156W	P0CE96	114 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	YLR159W	P0CE97	114 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	YLR161W	P0CE98	114 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.66	□□□□□ -1.98	not detected
MGR3	YMR115W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	MEI4	P29467	408 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MGR3	YMR115W	SCM4	P32564	187 aa		2.66	□□□□□ -1.98

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