RNA–Protein interactions for RNA: YHR076W

PTC7, Transcript of Type 2C serine/threonine protein phosphatase (PP2C), yeast

Gene PTC7, Length 1,032 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PTC7	YHR076W	FCY22	Q12119	530 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	BBP1	Q12365	385 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	AQY1	P0CD91	305 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	SEN2	P16658	377 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	AGA2	P32781	87 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	RPB7	P34087	171 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	YOX1	P34161	385 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	YPT53	P36019	220 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	POP2	P39008	433 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	YMR279C	Q03263	540 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	GMC1	Q04399	608 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	COA4	Q05809	96 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	FRE8	Q12209	686 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	YCT1	Q12235	531 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	GEP4	P38812	185 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	SLM1	P40485	686 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	YIR035C	P40579	254 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	UBP8	P50102	471 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	YNL046W	P53956	172 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	SKO1	Q02100	647 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	ECM18	Q04623	453 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	YDL242W	Q07746	117 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	DGK1	Q12382	290 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	TFC7	Q12415	435 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	TCA17	P32613	152 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	PDC2	P32896	925 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	SWD3	P38123	315 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	ERV15	P38312	142 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	VMA7	P39111	118 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	RMD6	P39975	231 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	XPT1	P47165	209 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	SRB7	P47822	140 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	JAC1	P53193	184 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	FIT1	Q04433	528 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	ANT1	Q06497	328 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	GAT3	Q07928	141 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	FEX2	Q08991	375 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	ATG31	Q12421	196 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	MRP20	P32387	263 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	MNS1	P32906	549 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	GON7	P46984	123 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	GPI15	P53961	229 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	SED1	Q01589	338 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	YOR292C	Q08743	309 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	AEP3	Q12089	606 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	DAL80	P26343	269 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	YER121W	P40076	114 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	PKP2	P53170	491 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	YNL092W	P53934	400 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	DID2	P69771	204 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	HSK3	P69852	69 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	TSA2	Q04120	196 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	RIM9	Q04734	239 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	FMP16	Q12497	93 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PTC7	YHR076W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	SEC22	P22214	214 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	LSB5	P25369	354 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	ERG2	P32352	222 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	CPR5	P35176	225 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	TAD2	P47058	250 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	UBC12	P52491	188 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	VPS28	Q02767	242 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	PAM18	Q07914	168 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	HRD1	Q08109	551 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	YBR085C-A	O43137	85 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	ECM14	P38836	430 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	PCL7	P40186	285 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.7	□□□□□ -1.5	not detected
PTC7	YHR076W	GEP7	P53171	287 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	RRT7	Q07829	113 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	SWT1	Q12104	458 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	RFM1	Q12192	310 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PTC7	YHR076W	YLR108C	Q12259	485 aa		5.7	□□□□□ -1.5

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