RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YOR062C	P36025	268 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	CMC1	P36064	111 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YKL071W	P36086	256 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	DRE2	P36152	348 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	DAD2	P36162	133 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	HSP10	P38910	106 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	SHO1	P40073	367 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YJL068C	P40363	299 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YPS6	P40583	537 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	RPA43	P46669	326 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	STE24	P47154	453 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	PDR17	P53844	350 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	IBD2	P53892	351 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	HHT1	P61830	136 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	CDC14	Q00684	551 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	IRC15	Q02733	499 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	EST3	Q03096	181 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	EMI1	Q04406	187 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	STP3	Q05937	343 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	MCH4	Q08268	501 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	MCP1	Q12106	302 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	TMS1	Q12116	473 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	UBX3	Q12229	455 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	MOT1	P32333	1867 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	UGX2	P32772	223 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	CBP4	P37267	147 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	SHE1	P38200	338 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	TRR2	P38816	342 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YHR210C	P38893	341 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	PRM5	P40476	318 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YIL060W	P40519	144 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	CAT5	P41735	233 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	UBP8	P50102	471 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YGR015C	P53208	328 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	LST7	P53237	242 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YLR460C	P54007	376 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	UBC7	Q02159	165 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	DPP1	Q05521	289 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	TAZ1	Q06510	381 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	SUE1	Q06524	206 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	PLB3	Q08108	686 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YDL157C	Q12082	118 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	IZH2	Q12442	317 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	RIM15	P43565	1770 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	VAR1	P02381	398 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	RAD6	P06104	172 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	YIH1	P25637	258 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	ATS1	P31386	333 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	ZRT1	P32804	376 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	SKN1	P33336	771 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	PAU24	P38155	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	YHR130C	P38834	111 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	YIR016W	P40572	265 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	ATG27	P46989	271 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	XPT1	P47165	209 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	TTI2	P47168	421 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	PAU12	P53343	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	CCE1	Q03702	353 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	NUP53	Q03790	475 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	CAB5	Q03941	241 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	BLS1	Q06071	122 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	YPR098C	Q06089	161 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	SRL1	Q08673	210 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	GRE1	Q08969	168 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	YPL264C	Q08980	353 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	RAX2	Q12465	1220 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	PCL9	Q12477	304 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ECO1	YFR027W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94

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