RNA–Protein interactions for RNA: tT(UGU)P

tT(UGU)P, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(UGU)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1B-ER1Q03612 1755 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1B-DR1Q03855 1755 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1B-GR1Q12141 1755 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1B-GR2Q12269 1755 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1B-OLQ12273 1755 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1B-ORQ92393 1755 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1B-DR3Q99231 1755 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P YER145C-AA0A023PYF4 145 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P GAL1P04385 528 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P RPS14AP06367 137 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P DCD1P06773 312 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P MOD5P07884 428 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TRK1P12685 1235 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P GAP1P19145 602 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P RNA14P25298 677 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P SPT5P27692 1063 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P FUN19P28003 413 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P PET127P32606 800 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P ESL2P36168 1195 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P SLI15P38283 698 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P GGA2P38817 585 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P SAK1P38990 1142 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P ACA1P39970 489 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P LCB2P40970 561 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P YFL052WP43551 465 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P YJR120WP47157 116 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P ENP2P48234 707 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P LYS4P49367 693 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P PIP2P52960 996 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P MSO1P53604 210 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P YNL247WP53852 767 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P BNI5P53890 448 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P SLG1P54867 378 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P KIN4Q01919 800 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P PNG1Q02890 363 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.49□□□□□ -2.49not detected
tT(UGU)PtT(UGU)P SWF1Q04629 336 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P RCO1Q04779 684 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P GIC2Q06648 383 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P FRA1Q07825 749 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P NCR1Q12200 1170 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P PUS1Q12211 544 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P YDR215CQ12240 137 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P MMP1Q12372 583 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P ZRT2Q12436 422 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P NSI1Q12457 570 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P MHP1P43638 1398 aa-0.49□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY2B-FP0CX63 1770 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY2B-GR2P0CX64 1770 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY2B-CP25384 1770 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY2B-DR2Q03494 1770 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY2B-OR1Q12113 1770 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY2B-DR1Q12472 1770 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY2B-BQ12491 1770 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY2B-OR2Q12501 1770 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY4B-HP0C2J7 1802 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY4B-JP47024 1803 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P SEC7P11075 2009 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1A-DR4O74302 440 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P AI1P03875 834 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P ADE4P04046 510 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P ARG81P05085 880 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P SUP35P05453 685 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P STE7P06784 515 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1A-AP0CX57 440 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1A-PR1P0CX58 440 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1A-ORP0CX59 440 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1A-PR2P0CX60 440 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1A-DR5P0CX65 440 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1A-ER2P0CX66 440 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1A-GR3P0CX67 440 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1A-LR1P0CX68 440 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1A-MR2P0CX69 440 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1A-DR6P0CX70 440 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1A-ER1P0CX71 440 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1A-LR2P0CX72 440 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1A-PLP0CX73 440 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1A-JR1P0CX74 440 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1A-LR3P0CX75 440 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1A-ML2P0CX76 440 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P YER190C-BP0CX94 160 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P YEL077W-AP0CX95 160 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P YGR296C-BP0CX96 160 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P YPL283W-BP0CX97 160 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P YPR204C-AP0CX98 160 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P PDA1P16387 420 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P DDR48P18899 430 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P SAG1P20840 650 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P SGV1P23293 657 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.5□□□□□ -2.49not detected
tT(UGU)PtT(UGU)P KAR4P25583 335 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P YUR1P26725 428 aa-0.5□□□□□ -2.49
tT(UGU)PtT(UGU)P MIG1P27705 504 aa-0.5□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.2 ms