RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)O

tK(UUU)O, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)O, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)OtK(UUU)O YDL144CQ07589 356 aa4.1□□□□□ -1.75
tK(UUU)OtK(UUU)O MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
tK(UUU)OtK(UUU)O TPD3P31383 635 aa4.09□□□□□ -1.75
tK(UUU)OtK(UUU)O RTG2P32608 588 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
tK(UUU)OtK(UUU)O APL2P36000 726 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
tK(UUU)OtK(UUU)O VPS27P40343 622 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
tK(UUU)OtK(UUU)O MPP10P47083 593 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
tK(UUU)OtK(UUU)O YJR008WP47085 338 aa4.09□□□□□ -1.75
tK(UUU)OtK(UUU)O YRB30P53107 440 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
tK(UUU)OtK(UUU)O PUS5Q06244 254 aa4.09□□□□□ -1.75
tK(UUU)OtK(UUU)O THI22Q06490 572 aa4.09□□□□□ -1.75
tK(UUU)OtK(UUU)O RIM15P43565 1770 aa4.09□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O GLC3P32775 704 aa4.08□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O NUG1P40010 520 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O DPL1Q05567 589 aa4.08□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O PSF3Q12146 194 aa4.08□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O DPH6Q12429 685 aa4.08□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O DCD1P06773 312 aa4.07□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O SSA4P22202 642 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O ITC1P53125 1264 aa4.07□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O ZDS2P54786 942 aa4.07□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O SRT1Q03175 343 aa4.07□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O RTT109Q07794 436 aa4.07□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O CDC45Q08032 650 aa4.07□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O MRP7P12687 371 aa4.06□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O CAF20P12962 161 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data4.06□□□□□ -1.76not detected
tK(UUU)OtK(UUU)O KRE2P27809 442 aa4.06□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O SET1P38827 1080 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O ICP55P40051 511 aa4.06□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O RRD1P40454 393 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O UBP16Q02863 499 aa4.06□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O MTC5Q03897 1148 aa4.06□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O PSH1Q12161 406 aa4.06□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O THS1P04801 734 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O DAL5P15365 543 aa4.05□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O NUP133P36161 1157 aa4.05□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O YGR117CP53270 476 aa4.05□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O TIM50Q02776 476 aa4.05□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O SRC1Q03707 834 aa4.05□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O CWC15Q03772 175 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O PRP42Q03776 544 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O YDR306CQ06640 478 aa4.05□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O AIM7Q12156 149 aa4.05□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O UBP12P39538 1254 aa4.04□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O VHR2P40041 505 aa4.04□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O PEA2P40091 420 aa4.04□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O YPP1P46951 817 aa4.04□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O HEF3P53978 1044 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O TYW1Q08960 810 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O RAD2P07276 1031 aa4.03□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O MGM1P32266 881 aa4.03□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O NGR1P32831 672 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O JJJ2P46997 583 aa4.03□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O HGH1P48362 394 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O RRT6P53117 311 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O AAD16Q02895 342 aa4.03□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
tK(UUU)OtK(UUU)O SWI1P09547 1314 aa4.02□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O SAC3P46674 1301 aa4.02□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O TRP5P00931 707 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O RPS19AP07280 144 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O AFG2P32794 780 aa4.02□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O BSD2P38356 321 aa4.02□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O SSF1P38789 453 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O FET4P40988 552 aa4.02□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O EMP47P43555 445 aa4.02□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O TRM44Q02648 567 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O FCP1Q03254 732 aa4.02□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O YLR278CQ05854 1341 aa4.01□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O GAL2P13181 574 aa4.01□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O SUI2P20459 304 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O TFA1P36100 482 aa4.01□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O RSC30P38781 883 aa4.01□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data4.01□□□□□ -1.77not detected
tK(UUU)OtK(UUU)O THI3Q07471 609 aa4.01□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O PIF1P07271 859 aa4□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O HPR1P17629 752 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O YIL089WP40500 205 aa4□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O RPT4P53549 437 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O RVB2Q12464 471 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O SRF1Q12516 437 aa4□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O TIF6Q12522 245 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O NCB2Q92317 146 aa4□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O YNG2P38806 282 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O SPL2P38839 148 aa3.99□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O BOI2P39969 1040 aa3.99□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O NIT1P40447 199 aa3.99□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O NOP2P40991 618 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O GSM1P42950 618 aa3.99□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O YFH7P43591 353 aa3.99□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O DUS1P53759 423 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O CSI1Q04368 295 aa3.99□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O WRS1Q12109 432 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
tK(UUU)OtK(UUU)O CBP1P07252 654 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 126.2 ms