RNA–Protein interactions for RNA: YOL108C

INO4, Transcript of Transcription factor involved in phospholipid synthesis, yeast

Gene INO4, Length 456 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
INO4	YOL108C	YGR035C	P53222	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	YLR346C	Q06139	101 aa		4.95	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	HDA3	Q06623	655 aa		4.95	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	SRF1	Q12516	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	KIP2	P28743	706 aa		4.94	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	IPL1	P38991	367 aa		4.94	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	YIR007W	P40566	764 aa		4.94	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	PUN1	Q06991	263 aa		4.94	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	SRS2	P12954	1174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	VAN1	P23642	535 aa		4.93	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	BOL3	P39724	118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	MDJ2	P42834	146 aa		4.93	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	YFL034W	P43564	1073 aa		4.93	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	APP1	P53933	587 aa		4.93	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	NTH2	P35172	780 aa		4.92	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	NUP85	P46673	744 aa		4.92	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	HPF1	Q05164	967 aa		4.92	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	SEC20	P28791	383 aa		4.91	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	SUV3	P32580	737 aa		4.91	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	SCW11	P53189	542 aa		4.91	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	TRS33	Q99394	268 aa		4.91	□□□□□ -1.62
INO4	YOL108C	RRN6	P32786	894 aa		4.9	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	YHL050C	P38721	697 aa		4.9	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	YHR219W	P38900	624 aa		4.9	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	ATG1	P53104	897 aa		4.9	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	SWI5	P08153	709 aa		4.89	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	UBP1	P25037	809 aa		4.89	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	ISU1	Q03020	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	CYT1	P07143	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	FBP26	P32604	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	UTR2	P32623	467 aa		4.88	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	MKS1	P34072	584 aa		4.88	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	QDR1	P40475	563 aa		4.88	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	ACF4	P47129	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	LSO1	Q3E827	93 aa		4.87	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	PPX1	P38698	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	RTT106	P40161	455 aa		4.86	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	CWH41	P53008	833 aa		4.86	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	FRT1	Q99332	602 aa		4.86	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	STE6	P12866	1290 aa		4.85	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	ATE1	P16639	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	TBS1	P38114	1094 aa		4.85	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	YBL086C	P38177	466 aa		4.85	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	YBR197C	P38306	217 aa		4.85	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	DFG5	Q05031	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	NUT2	Q06213	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	WHI5	Q12416	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	ASF1	P32447	279 aa		4.84	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	ALD2	P47771	506 aa		4.84	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	WTM2	Q12206	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
INO4	YOL108C	THI12	P42883	340 aa		4.83	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	AAD14	P42884	376 aa		4.83	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	THI5	P43534	340 aa		4.83	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	POL32	P47110	350 aa		4.83	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	THI11	P47183	340 aa		4.83	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	LSC2	P53312	427 aa		4.83	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	CAB1	Q04430	367 aa		4.83	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	THI13	Q07748	340 aa		4.83	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	ISC10	P32645	267 aa		4.82	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	UBP2	Q01476	1272 aa		4.82	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	BDS1	Q08347	646 aa		4.82	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	ARG82	P07250	355 aa		4.81	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	MET4	P32389	672 aa		4.81	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	MET10	P39692	1035 aa		4.81	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	ICP55	P40051	511 aa		4.81	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	YPQ2	Q06328	317 aa		4.81	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	APC11	Q12157	165 aa		4.81	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	HXT5	P38695	592 aa		4.8	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	YJR098C	P47139	656 aa		4.8	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	TRS120	Q04183	1289 aa		4.8	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	MCM1	P11746	286 aa		4.79	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	RPB10	P22139	70 aa		4.79	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	DLD1	P32891	587 aa		4.79	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	SPR3	P41901	512 aa		4.79	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	ROG3	P43602	733 aa		4.79	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	SUM1	P46676	1062 aa		4.79	□□□□□ -1.64
INO4	YOL108C	GPI13	Q07830	1017 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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