RNA–Protein interactions for RNA: YGR161C-D

YGR161C-D, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeast

Gene YGR161C-D, Length 5,268 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGR161C-D	YGR161C-D	BDF2	Q07442	638 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	CBF2	P32504	956 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	MRK1	P50873	501 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	NUP170	P38181	1502 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	CAT8	P39113	1433 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	IDI1	P15496	288 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	SEC8	P32855	1065 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	RSM26	P47141	266 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	COS5	P47187	383 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	DNM1	P54861	757 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	SKY1	Q03656	742 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	SPO71	Q03868	1245 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	FBP1	P09201	348 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	ATG19	P35193	415 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	DOT5	P40553	215 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	CIT3	P43635	486 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	GIN4	Q12263	1142 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	SNA3	P14359	133 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	TCA17	P32613	152 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	FPK1	P53739	893 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	OSW2	Q12202	724 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YGR161C-D	YGR161C-D	PIF1	P07271	859 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	STE11	P23561	717 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	DLD1	P32891	587 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	SAP185	P40856	1058 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	NNF1	P47149	201 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	FMP30	Q02883	468 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	RAD50	P12753	1312 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	MYO4	P32492	1471 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	ERG12	P07277	443 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	VPS45	P38932	577 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	SAK1	P38990	1142 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	URB2	P47108	1174 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	IQG1	Q12280	1495 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	DSN1	P40568	576 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	VID27	P40157	782 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	VTC4	P47075	721 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	CLC1	P17891	233 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	CLN2	P20438	545 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	CAB1	Q04430	367 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	BI4	P03879	638 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	DCD1	P06773	312 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	FYV10	P40492	516 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	RTC4	P53850	401 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	PTC3	P34221	468 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	YFR018C	P43599	363 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	HEH2	Q03281	663 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	NSE5	Q03718	556 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	YCG1	Q06680	1035 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	YRF1-4	O13559	1382 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	CSM2	P40465	213 aa		3	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	CIR1	P42940	261 aa		3	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	TFB3	Q03290	321 aa		3	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	GAS4	Q08271	471 aa		3	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	HFI1	Q12060	488 aa		3	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	MAM3	Q12296	706 aa		3	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	VPS5	Q92331	675 aa		3	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	SRF1	Q12516	437 aa		3	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	COQ8	P27697	501 aa		3	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	YTA6	P40328	754 aa		3	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	BRE2	P43132	505 aa		3	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	NPA3	P47122	385 aa		3	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	DNF1	P32660	1571 aa		3	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	ACE2	P21192	770 aa		3	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	DSF2	P38213	736 aa		3	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	PBY1	P38254	753 aa		3	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	3	□□□□□ -1.93	not detected
YGR161C-D	YGR161C-D	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	MLS1	P30952	554 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	PSF2	P40359	213 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	YPR084W	Q06821	456 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	RTG3	P38165	486 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	VTC2	P43585	828 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YGR161C-D	YGR161C-D	MDR1	P53258	950 aa		2.99	□□□□□ -1.93

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