RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDI1	YER143W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	YJL181W	P46987	611 aa		11	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	YJR008W	P47085	338 aa		11	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	MSB4	Q12317	492 aa		11	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	SWI1	P09547	1314 aa		11	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	MRP7	P12687	371 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	ARG8	P18544	423 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	RAD24	P32641	659 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	MGA2	P40578	1113 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	SSP2	Q08646	371 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	YPR204W	Q08995	1032 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	PHM7	Q12252	991 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	DNM1	P54861	757 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	UBP1	P25037	809 aa		10.97	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	CST6	P40535	587 aa		10.96	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	MDG1	P53885	366 aa		10.96	□□□□□ -0.65
DDI1	YER143W	CTH1	P47976	325 aa		10.95	□□□□□ -0.66
DDI1	YER143W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	10.95	□□□□□ -0.66
DDI1	YER143W	CST9	Q06032	482 aa		10.95	□□□□□ -0.66
DDI1	YER143W	NYV1	Q12255	253 aa		10.95	□□□□□ -0.66
DDI1	YER143W	BOI2	P39969	1040 aa		10.94	□□□□□ -0.66
DDI1	YER143W	VNX1	P42839	908 aa		10.94	□□□□□ -0.66
DDI1	YER143W	TEA1	P47988	759 aa		10.94	□□□□□ -0.66
DDI1	YER143W	SWC3	P31376	625 aa		10.93	□□□□□ -0.66
DDI1	YER143W	NUP133	P36161	1157 aa		10.93	□□□□□ -0.66
DDI1	YER143W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	10.93	□□□□□ -0.66
DDI1	YER143W	VPS64	Q03944	604 aa		10.93	□□□□□ -0.66
DDI1	YER143W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	10.92	□□□□□ -0.66
DDI1	YER143W	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	10.92	□□□□□ -0.66
DDI1	YER143W	SPO1	P53541	631 aa		10.91	□□□□□ -0.66
DDI1	YER143W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
DDI1	YER143W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
DDI1	YER143W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
DDI1	YER143W	YGL082W	P53155	381 aa		10.89	□□□□□ -0.67
DDI1	YER143W	BUG1	Q12191	341 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DDI1	YER143W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
DDI1	YER143W	GTT3	P39996	337 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DDI1	YER143W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
DDI1	YER143W	YBL086C	P38177	466 aa		10.86	□□□□□ -0.67
DDI1	YER143W	UBP12	P39538	1254 aa		10.86	□□□□□ -0.67
DDI1	YER143W	FCP1	Q03254	732 aa		10.86	□□□□□ -0.67
DDI1	YER143W	WSC3	Q12215	556 aa		10.85	□□□□□ -0.67
DDI1	YER143W	TOS1	P38288	455 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DDI1	YER143W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
DDI1	YER143W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
DDI1	YER143W	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
DDI1	YER143W	HXT10	P43581	546 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DDI1	YER143W	ALD2	P47771	506 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DDI1	YER143W	ITC1	P53125	1264 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DDI1	YER143W	VPS29	P38759	282 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DDI1	YER143W	SPP1	Q03012	353 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DDI1	YER143W	PKH1	Q03407	766 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DDI1	YER143W	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.81	□□□□□ -0.68	not detected
DDI1	YER143W	PIB1	Q06651	286 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DDI1	YER143W	SAC3	P46674	1301 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DDI1	YER143W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DDI1	YER143W	ALD3	P54114	506 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDI1	YER143W	MTC5	Q03897	1148 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDI1	YER143W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DDI1	YER143W	PSH1	Q12161	406 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DDI1	YER143W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DDI1	YER143W	HAT1	Q12341	374 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDI1	YER143W	PMD1	P32634	1753 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDI1	YER143W	RPC31	P17890	251 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDI1	YER143W	CDC16	P09798	840 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDI1	YER143W	UGA2	P38067	497 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDI1	YER143W	CTI6	Q08923	506 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDI1	YER143W	NKP2	Q06162	153 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DDI1	YER143W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
DDI1	YER143W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
DDI1	YER143W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
DDI1	YER143W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
DDI1	YER143W	UBP16	Q02863	499 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DDI1	YER143W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
DDI1	YER143W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
DDI1	YER143W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
DDI1	YER143W	HPC2	Q01448	625 aa		10.73	□□□□□ -0.69
DDI1	YER143W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
DDI1	YER143W	SLA1	P32790	1244 aa		10.72	□□□□□ -0.69
DDI1	YER143W	BDF2	Q07442	638 aa		10.72	□□□□□ -0.69
DDI1	YER143W	ADR1	P07248	1323 aa		10.71	□□□□□ -0.69
DDI1	YER143W	RAD50	P12753	1312 aa		10.71	□□□□□ -0.69
DDI1	YER143W	FIG2	P25653	1609 aa		10.7	□□□□□ -0.7
DDI1	YER143W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
DDI1	YER143W	GYP5	Q12344	894 aa		10.7	□□□□□ -0.7
DDI1	YER143W	NCB2	Q92317	146 aa		10.7	□□□□□ -0.7
DDI1	YER143W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
DDI1	YER143W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
DDI1	YER143W	BDP1	P46678	594 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDI1	YER143W	YGL242C	P53066	181 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDI1	YER143W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
DDI1	YER143W	STS1	P38637	319 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDI1	YER143W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
DDI1	YER143W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
DDI1	YER143W	PFF1	P38244	976 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDI1	YER143W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 45.8 ms