RNA–Protein interactions for RNA: Q0120

BI4, Transcript of Mitochondrial mRNA maturase, yeast

Gene BI4, Length 1,917 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BI4	Q0120	YJR098C	P47139	656 aa		5.01	□□□□□ -1.61
BI4	Q0120	LSC2	P53312	427 aa		5	□□□□□ -1.61
BI4	Q0120	OPT2	Q06593	877 aa		5	□□□□□ -1.61
BI4	Q0120	SSN3	P39073	555 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BI4	Q0120	SUM1	P46676	1062 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BI4	Q0120	GAS4	Q08271	471 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BI4	Q0120	YPQ2	Q06328	317 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BI4	Q0120	YDR444W	Q04093	687 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BI4	Q0120	TCB1	Q12466	1186 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BI4	Q0120	CYT1	P07143	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BI4	Q0120	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BI4	Q0120	DAL1	P32375	460 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	YLR346C	Q06139	101 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	MSN5	P52918	1224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	UBP2	Q01476	1272 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	VAN1	P23642	535 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	UBP1	P25037	809 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
BI4	Q0120	SLA1	P32790	1244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	VTC4	P47075	721 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	SUV3	P32580	737 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	SCW11	P53189	542 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	YNL165W	P53891	406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	MCM1	P11746	286 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	OSH7	P38755	437 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	JJJ2	P46997	583 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	GEF1	P37020	779 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	TRS33	Q99394	268 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	PUN1	Q06991	263 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	IRE1	P32361	1115 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	HXT5	P38695	592 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BI4	Q0120	ACO2	P39533	789 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	CWH41	P53008	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	CAB1	Q04430	367 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	PNP1	Q05788	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	YDL176W	Q12027	708 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	PSH1	Q12161	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	SRS2	P12954	1174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	MLF3	P32047	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	YIR007W	P40566	764 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	CAF120	P53836	1060 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	YBR197C	P38306	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	UBP15	P50101	1230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	ROG3	P43602	733 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	CCP1	P00431	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	SCD5	P34758	872 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	ISC10	P32645	267 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	ALD2	P47771	506 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	BOL3	P39724	118 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BI4	Q0120	MRPL33	P20084	86 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	YTA6	P40328	754 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	CUZ1	P53899	274 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	YPL062W	Q02781	134 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	VMA3	P25515	160 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	KAR5	Q04746	504 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	MRPL16	P38064	232 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	MTO1	P53070	669 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	RRN6	P32786	894 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	QDR2	P40474	542 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	HAT1	Q12341	374 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	LSO1	Q3E827	93 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	RGP1	P16664	663 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	DIT1	P21623	536 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	KAP122	P32767	1081 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	SPR3	P41901	512 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	STB3	Q12427	513 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	RPC31	P17890	251 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	RIP-Chip
BI4	Q0120	KTR2	P33550	425 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	APC11	Q12157	165 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BI4	Q0120	RPB10	P22139	70 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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