RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000217351.1

Ccdc84-212, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Ccdc84, Length 888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Mphosph9A6H5Y1 991 aa31,68■■■□□ 2,66
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Myo3aQ8K3H5 1613 aa31,67■■■□□ 2,66
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 PplQ9R269 1755 aa31,66■■■□□ 2,66
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Med1Q925J9 1575 aa31,66■■■□□ 2,66
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Setd1aE9PYH6 1716 aa31,65■■■□□ 2,66
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP31,65■■■□□ 2,66
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Sall3Q62255 1320 aa31,65■■■□□ 2,66
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa31,63■■■□□ 2,65
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP31,62■■■□□ 2,65
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Iqsec2Q5DU25 1478 aa31,62■■■□□ 2,65
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Bcl11bQ99PV8 884 aa31,62■■■□□ 2,65
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Mroh1E0CZ22 1640 aa31,61■■■□□ 2,65
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Abca8aQ8K442 1620 aa31,61■■■□□ 2,65
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Pik3c2gO70167 1506 aa31,59■■■□□ 2,65
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Kif21bQ9QXL1 1668 aa31,57■■■□□ 2,65
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa31,57■■■□□ 2,64
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 IghaA0A0A6YXW6 389 aa31,56■■■□□ 2,64
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 PalldQ9ET54 1408 aa31,56■■■□□ 2,64
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP31,55■■■□□ 2,64
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Atp1b4Q99ME6 356 aa31,53■■■□□ 2,64
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 AatkQ80YE4 1365 aa31,53■■■□□ 2,64
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Asxl2Q8BZ32 1370 aa31,5■■■□□ 2,63
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa31,49■■■□□ 2,63
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa31,49■■■□□ 2,63
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Arhgef28P97433 1693 aa31,48■■■□□ 2,63
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Pkd2O35245 966 aa31,46■■■□□ 2,63
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ccer2J3QPU5 274 aa31,43■■■□□ 2,62
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP31,42■■■□□ 2,62
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Slit3Q9WVB4 1523 aa31,42■■■□□ 2,62
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Amigo3Q8C2S7 508 aa31,37■■■□□ 2,61
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 AU022751B1B0V2 589 aa31,36■■■□□ 2,61
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa31,35■■■□□ 2,61
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Q9D9H8 365 aa31,35■■■□□ 2,61
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Col18a1P39061 1774 aa31,34■■■□□ 2,61
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Dot1lQ6XZL8 1540 aa31,34■■■□□ 2,61
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa31,33■■■□□ 2,61
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Shq1Q7TMX5 569 aa31,32■■■□□ 2,6
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Tns3Q5SSZ5 1440 aa31,32■■■□□ 2,6
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP31,32■■■□□ 2,6
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP31,29■■■□□ 2,6
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Mbd5B1AYB6 1498 aa31,29■■■□□ 2,6
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Evi5lH3BKQ3 813 aa31,29■■■□□ 2,6
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa31,26■■■□□ 2,6
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa31,26■■■□□ 2,6
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Brinp3Q499E0 766 aa31,25■■■□□ 2,59
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 DnmbpQ6TXD4 1580 aa31,25■■■□□ 2,59
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Slain2Q8CI08 581 aa31,24■■■□□ 2,59
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Pik3r4Q8VD65 1358 aa31,21■■■□□ 2,59
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Washc2Q6PGL7 1334 aa31,21■■■□□ 2,59
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Tom1O88746 492 aa31,19■■■□□ 2,58
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP31,18■■■□□ 2,58
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Mier1Q5UAK0 511 aa31,17■■■□□ 2,58
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Gimap5Q8BWF2 308 aa31,14■■■□□ 2,58
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Tmem94Q7TSH8 1360 aa31,14■■■□□ 2,58
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Arap3Q8R5G7 1538 aa31,14■■■□□ 2,57
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Rock1P70335 1354 aa31,11■■■□□ 2,57
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa31,11■■■□□ 2,57
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Rims1Q99NE5 1463 aa31,08■■■□□ 2,57
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Rgl3Q3UYI5 709 aa31,08■■■□□ 2,57
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Eid3Q3V124 375 aa31,08■■■□□ 2,57
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Pik3c2aQ61194 1686 aa31,07■■■□□ 2,56
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Tulp4Q9JIL5 1547 aa31,07■■■□□ 2,56
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Col14a1Q80X19 1797 aa31,07■■■□□ 2,56
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ift172Q6VH22 1749 aa31,05■■■□□ 2,56
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Kdm2aP59997 1161 aa31,05■■■□□ 2,56
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Atf3Q60765 181 aa31,05■■■□□ 2,56
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Os9Q8K2C7 672 aa31,05■■■□□ 2,56
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 MaddQ80U28 1577 aa31,05■■■□□ 2,56
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Usp47Q8BY87 1376 aa31,04■■■□□ 2,56
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa31,02■■■□□ 2,56
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Stk26Q99JT2 416 aa31,02■■■□□ 2,56
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Nwd1A6H603 1563 aa31,01■■■□□ 2,56
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Slc52a2Q9D8F3 450 aa31,01■■■□□ 2,55
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP31■■■□□ 2,55
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Cps1Q8C196 1500 aa30,99■■■□□ 2,55
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ttll13A4Q9F6 804 aa30,99■■■□□ 2,55
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP30,99■■■□□ 2,55
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 GapdhsQ64467 440 aa30,99■■■□□ 2,55
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Fan1Q69ZT1 1020 aa30,97■■■□□ 2,55
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Adamts13Q769J6 1426 aa30,97■■■□□ 2,55
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 NalcnQ8BXR5 1738 aa30,96■■■□□ 2,55
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP30,94■■■□□ 2,54
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP30,93■■■□□ 2,54
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Dapk1Q80YE7 1442 aa30,9■■■□□ 2,54
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa30,9■■■□□ 2,54
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Gm20521D3Z5F7 333 aa30,89■■■□□ 2,54
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Nyap1Q6PFX7 833 aa30,88■■■□□ 2,53
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP30,88■■■□□ 2,53
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa30,87■■■□□ 2,53
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP30,87■■■□□ 2,53
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 C3P01027 1663 aa30,87■■■□□ 2,53
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP30,87■■■□□ 2,53
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Qtrt2B8ZXI1 415 aa30,86■■■□□ 2,53
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP30,86■■■□□ 2,53
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa30,85■■■□□ 2,53
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Gm10563F6WIE4 79 aa30,85■■■□□ 2,53
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Lrrc7Q80TE7 1490 aa30,84■■■□□ 2,53
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Q3UJC8 639 aa30,84■■■□□ 2,53
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Fbln2P37889 1221 aa30,83■■■□□ 2,53
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa30,82■■■□□ 2,52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29,1 ms