RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000217351.1

Ccdc84-212, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Ccdc84, Length 888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa48,85■■■■■ 5,41
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 NischQ80TM9 1593 aa48,21■■■■■ 5,31
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Abcc8B2RUS7 1588 aa46,61■■■■■ 5,05
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Abcc9P70170 1546 aa46,59■■■■■ 5,05
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 ScribQ80U72 1612 aa45,07■■■■■ 4,81
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 NacadQ5SWP3 1504 aa43,61■■■■■ 4,57
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Kdm5dQ62240 1548 aa43,55■■■■■ 4,56
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Dcaf1Q80TR8 1506 aa42,76■■■■■ 4,44
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Sycp2Q9CUU3 1500 aa42,76■■■■■ 4,44
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 BicraF8VPZ9 1578 aa42,21■■■■■ 4,35
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa42,04■■■■■ 4,32
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Rhox8Q6VSS7 320 aa41,66■■■■■ 4,26
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Baz1aO88379 1555 aa41,39■■■■■ 4,22
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa41,32■■■■■ 4,21
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ccdc180J3QNE4 1664 aa41,31■■■■■ 4,2
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Crybg2B7ZCC2 1516 aa41,17■■■■■ 4,18
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP41,06■■■■■ 4,16
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP40,9■■■■■ 4,14
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP40,77■■■■■ 4,12
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP40,64■■■■■ 4,1
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP40,27■■■■■ 4,04
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ercc6F8VPZ5 1481 aa40,25■■■■■ 4,03
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Smarca2Q6DIC0 1577 aa40,19■■■■■ 4,02
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa40,17■■■■■ 4,02
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa40,13■■■■■ 4,01
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa40,09■■■■■ 4,01
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Fam135aQ6NS59 1506 aa39,81■■■■□ 3,96
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Wdr62Q3U3T8 1523 aa39,74■■■■□ 3,95
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Frmpd1A2AKB4 1549 aa39,7■■■■□ 3,95
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP39,51■■■■□ 3,92
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Rtl1Q7M732 1744 aa39,51■■■■□ 3,91
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Baz1bQ9Z277 1479 aa39,25■■■■□ 3,87
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ubl4bQ9CQ84 188 aa39,24■■■■□ 3,87
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Unc13aQ4KUS2 1712 aa39,22■■■■□ 3,87
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa39,16■■■■□ 3,86
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 CftrP26361 1476 aa39,15■■■■□ 3,86
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Synj1Q8CHC4 1574 aa39,11■■■■□ 3,85
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP39,03■■■■□ 3,84
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa39,01■■■■□ 3,84
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Mrc2Q64449 1479 aa38,92■■■■□ 3,82
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP38,61■■■■□ 3,77
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Trim41Q5NCC3 630 aa38,33■■■■□ 3,73
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP38,31■■■■□ 3,72
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Kif15Q6P9L6 1387 aa38,28■■■■□ 3,72
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Cux2P70298 1426 aa38,28■■■■□ 3,72
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa38,12■■■■□ 3,69
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Lamc3Q9R0B6 1581 aa38,06■■■■□ 3,68
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Kif21aQ9QXL2 1672 aa38,04■■■■□ 3,68
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP37,91■■■■□ 3,66
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Cep164Q5DU05 1446 aa37,73■■■■□ 3,63
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Golga3P55937 1487 aa37,61■■■■□ 3,61
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Cngb1E1AZ71 1325 aa37,6■■■■□ 3,61
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Il27Q8K3I6 234 aa37,59■■■■□ 3,61
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Top2bQ64511 1612 aa37,58■■■■□ 3,61
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 TnnQ80Z71 1560 aa37,57■■■■□ 3,6
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP37,55■■■■□ 3,6
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ccdc18Q640L5 1455 aa37,54■■■■□ 3,6
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Dnajc5P60904 198 aa37,52■■■■□ 3,6
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP37,45■■■■□ 3,59
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP37,41■■■■□ 3,58
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Camsap1A2AHC3 1581 aa37,38■■■■□ 3,58
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Plb1Q3TTY0 1478 aa37,35■■■■□ 3,57
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP37,34■■■■□ 3,57
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Crocc2F6XLV1 1638 aa37,29■■■■□ 3,56
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Fmn1Q05860 1466 aa37,21■■■■□ 3,55
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Shroom2A2ALU4 1481 aa37,11■■■■□ 3,53
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP37,1■■■■□ 3,53
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ift140E9PY46 1464 aa37■■■■□ 3,51
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Duox2A2AQ99 1517 aa36,95■■■■□ 3,5
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Rusc2Q80U22 1514 aa36,9■■■■□ 3,5
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Grin2bQ01097 1482 aa36,84■■■■□ 3,49
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP36,8■■■■□ 3,48
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Disp1Q3TDN0 1521 aa36,7■■■■□ 3,47
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP36,67■■■■□ 3,46
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Samd9lQ69Z37 1561 aa36,66■■■■□ 3,46
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Col17a1Q07563 1470 aa36,64■■■■□ 3,46
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Setd1bQ8CFT2 1985 aa36,61■■■■□ 3,45
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Efcab5A0JP43 1406 aa36,59■■■■□ 3,45
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa36,58■■■■□ 3,45
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP36,57■■■■□ 3,44
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP36,52■■■■□ 3,44
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa36,5■■■■□ 3,43
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP36,46■■■■□ 3,43
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Rad54l2Q99NG0 1466 aa36,45■■■■□ 3,43
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 NrkQ9R0G8 1455 aa36,37■■■■□ 3,41
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Chic1Q8CBW7 227 aa36,34■■■■□ 3,41
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Grin2aP35436 1464 aa36,33■■■■□ 3,41
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Magi3Q9EQJ9 1476 aa36,3■■■■□ 3,4
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP36,26■■■■□ 3,39
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP36,25■■■■□ 3,39
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Shroom4Q1W617 1475 aa36,23■■■■□ 3,39
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 PtprkP35822 1457 aa36,2■■■■□ 3,39
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Fgd6Q69ZL1 1399 aa36,15■■■■□ 3,38
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 SynmQ70IV5 1561 aa36,1■■■■□ 3,37
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Pla2r1Q62028 1487 aa36,08■■■■□ 3,37
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Zeb1Q64318 1117 aa36,08■■■■□ 3,37
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 AknaQ80VW7 1404 aa35,98■■■■□ 3,35
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Gpatch8A2A6A1 1505 aa35,97■■■■□ 3,35
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Adgrl3Q80TS3 1537 aa35,93■■■■□ 3,34
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa35,92■■■■□ 3,34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24,1 ms