RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000198296.1

Gm43017-201, mousemouse

BASIC

Gene Gm43017, Length 752 nt, Biotype sense intronic.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Ube2uB1AUC4 352 aa29.86■■■□□ 2.37
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Psme1P97371 249 aa29.85■■■□□ 2.37
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Tecpr2Q3UH45 1423 aa29.84■■■□□ 2.37
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Tarbp1E9Q368 1579 aa29.84■■■□□ 2.37
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Uggt1Q6P5E4 1551 aa29.84■■■□□ 2.37
Gm43017-201ENSMUST00000198296 DnmbpQ6TXD4 1580 aa29.82■■■□□ 2.36
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Amigo3Q8C2S7 508 aa29.82■■■□□ 2.36
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Stk24Q99KH8 431 aa29.82■■■□□ 2.36
Gm43017-201ENSMUST00000198296 IghaA0A0A6YXW6 389 aa29.8■■■□□ 2.36
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa29.79■■■□□ 2.36
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Atp7aQ64430 1491 aa29.78■■■□□ 2.36
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Col18a1P39061 1774 aa29.75■■■□□ 2.35
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa29.74■■■□□ 2.35
Gm43017-201ENSMUST00000198296 PtprgQ05909 1442 aa29.74■■■□□ 2.35
Gm43017-201ENSMUST00000198296 PalldQ9ET54 1408 aa29.73■■■□□ 2.35
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Trak1Q6PD31 939 aa29.73■■■□□ 2.35
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Mroh1E0CZ22 1640 aa29.72■■■□□ 2.35
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Mia2Q91ZV0 1396 aa29.71■■■□□ 2.35
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Mbd5B1AYB6 1498 aa29.71■■■□□ 2.35
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Asxl2Q8BZ32 1370 aa29.7■■■□□ 2.35
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Abca8aQ8K442 1620 aa29.7■■■□□ 2.34
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Arhgef28P97433 1693 aa29.67■■■□□ 2.34
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Sall3Q62255 1320 aa29.67■■■□□ 2.34
Gm43017-201ENSMUST00000198296 ErbinQ80TH2 1402 aa29.66■■■□□ 2.34
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Cypt1Q8CH20 168 aa29.65■■■□□ 2.34
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Pik3c2gO70167 1506 aa29.65■■■□□ 2.34
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Pik3c2aQ61194 1686 aa29.64■■■□□ 2.34
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Brinp3Q499E0 766 aa29.64■■■□□ 2.34
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Slit3Q9WVB4 1523 aa29.64■■■□□ 2.34
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa29.62■■■□□ 2.33
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Tom1O88746 492 aa29.62■■■□□ 2.33
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Tns3Q5SSZ5 1440 aa29.61■■■□□ 2.33
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Evi5lH3BKQ3 813 aa29.58■■■□□ 2.33
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Gimap5Q8BWF2 308 aa29.54■■■□□ 2.32
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Atp1b4Q99ME6 356 aa29.54■■■□□ 2.32
Gm43017-201ENSMUST00000198296 AatkQ80YE4 1365 aa29.52■■■□□ 2.32
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Arap3Q8R5G7 1538 aa29.52■■■□□ 2.32
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Kif7B7ZNG0 1348 aa29.51■■■□□ 2.32
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Slain2Q8CI08 581 aa29.51■■■□□ 2.31
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Kif21bQ9QXL1 1668 aa29.5■■■□□ 2.31
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Fbln2P37889 1221 aa29.48■■■□□ 2.31
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Nyap1Q6PFX7 833 aa29.45■■■□□ 2.31
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa29.45■■■□□ 2.3
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Q9D9H8 365 aa29.43■■■□□ 2.3
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
Gm43017-201ENSMUST00000198296 AU022751B1B0V2 589 aa29.41■■■□□ 2.3
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Ttll13A4Q9F6 804 aa29.39■■■□□ 2.3
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Mphosph9A6H5Y1 991 aa29.39■■■□□ 2.3
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa29.37■■■□□ 2.29
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Tmem94Q7TSH8 1360 aa29.37■■■□□ 2.29
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Col14a1Q80X19 1797 aa29.36■■■□□ 2.29
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Shq1Q7TMX5 569 aa29.36■■■□□ 2.29
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Pik3r4Q8VD65 1358 aa29.36■■■□□ 2.29
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Slit2Q9R1B9 1521 aa29.35■■■□□ 2.29
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Nwd1A6H603 1563 aa29.34■■■□□ 2.29
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa29.33■■■□□ 2.29
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Ift172Q6VH22 1749 aa29.33■■■□□ 2.29
Gm43017-201ENSMUST00000198296 NalcnQ8BXR5 1738 aa29.31■■■□□ 2.28
Gm43017-201ENSMUST00000198296 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Atf3Q60765 181 aa29.29■■■□□ 2.28
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Cypt2Q6P924 180 aa29.29■■■□□ 2.28
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Dot1lQ6XZL8 1540 aa29.29■■■□□ 2.28
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Qtrt2B8ZXI1 415 aa29.27■■■□□ 2.28
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa29.24■■■□□ 2.27
Gm43017-201ENSMUST00000198296 MaddQ80U28 1577 aa29.22■■■□□ 2.27
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Dapk1Q80YE7 1442 aa29.21■■■□□ 2.27
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Zfp142G5E869 1843 aa29.21■■■□□ 2.27
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Cps1Q8C196 1500 aa29.2■■■□□ 2.27
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Pkd2O35245 966 aa29.2■■■□□ 2.26
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa29.2■■■□□ 2.26
Gm43017-201ENSMUST00000198296 C3P01027 1663 aa29.2■■■□□ 2.26
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa29.19■■■□□ 2.26
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa29.18■■■□□ 2.26
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Sema6bO54951 886 aa29.18■■■□□ 2.26
Gm43017-201ENSMUST00000198296 PtprvP70289 1705 aa29.16■■■□□ 2.26
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa29.16■■■□□ 2.26
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Cntnap1O54991 1385 aa29.14■■■□□ 2.26
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa29.14■■■□□ 2.26
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Adgrl1Q80TR1 1466 aa29.14■■■□□ 2.26
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa29.12■■■□□ 2.25
Gm43017-201ENSMUST00000198296 KdrP35918 1367 aa29.12■■■□□ 2.25
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Washc2Q6PGL7 1334 aa29.11■■■□□ 2.25
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Rims1Q99NE5 1463 aa29.09■■■□□ 2.25
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Tulp4Q9JIL5 1547 aa29.06■■■□□ 2.24
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Kif24Q6NWW5 1356 aa29.06■■■□□ 2.24
Gm43017-201ENSMUST00000198296 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa29.05■■■□□ 2.24
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Znf526Q8BI66 675 aa29.05■■■□□ 2.24
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Stk26Q99JT2 416 aa29.05■■■□□ 2.24
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa29.05■■■□□ 2.24
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Siglec1Q62230 1695 aa29.03■■■□□ 2.24
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Lrp6O88572 1613 aa29.03■■■□□ 2.24
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35 ms