RNA–Protein interactions for RNA: YPR057W

BRR1, Transcript of snRNP protein component of spliceosomal snRNPs, yeastyeast

Gene BRR1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRR1YPR057W IPP1P00817 287 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W ERV15P38312 142 aa7.96□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W AGX1P43567 385 aa7.96□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W BUL1P48524 976 aa7.96□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W PKP2P53170 491 aa7.96□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W FIT1Q04433 528 aa7.96□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W ASM4Q05166 528 aa7.96□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W ERP1Q05359 219 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W YOL029CQ08187 201 aa7.96□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W YOL118CQ08259 102 aa7.96□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W FCY22Q12119 530 aa7.96□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W HUG1Q6Q5K6 68 aa7.96□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W GCN1P33892 2672 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W YBR220CP38318 560 aa7.95□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W YEA6P39953 335 aa7.95□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W PHO23P50947 330 aa7.95□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W DPB4Q04603 196 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W GAT3Q07928 141 aa7.95□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W YOR292CQ08743 309 aa7.95□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W TEL1P38110 2787 aa7.95□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W CDC39P25655 2108 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W RPS23BP0CX30 145 aa7.94□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W RMD6P39975 231 aa7.94□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W GON7P46984 123 aa7.94□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W YJR012CP47087 207 aa7.94□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W YIF1P53845 314 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W CRZ1P53968 678 aa7.94□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W RIM9Q04734 239 aa7.94□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W ALG6Q12001 544 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W HSK3P69852 69 aa7.93□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W YMR279CQ03263 540 aa7.93□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W CAC2Q04199 468 aa7.93□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W LIP2Q06005 328 aa7.93□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W SWT1Q12104 458 aa7.93□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W MRS4P23500 304 aa7.92□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W COQ2P32378 372 aa7.92□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W SKO1Q02100 647 aa7.92□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W HED1Q03937 162 aa7.92□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W DGK1Q12382 290 aa7.92□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W YML003WP0CF16 290 aa7.91□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W SLM1P40485 686 aa7.91□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W AIR1P40507 360 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W EMC5P40540 141 aa7.91□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W MSO1P53604 210 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W ODC1Q03028 310 aa7.91□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W PAM18Q07914 168 aa7.91□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W ZRC1P20107 442 aa7.9□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W ECM31P38122 312 aa7.9□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W SLM6P38343 150 aa7.9□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W YGP1P38616 354 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W YEA4P40004 342 aa7.9□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W TOK1P40310 691 aa7.9□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W RFC2P40348 353 aa7.9□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W SNN1P48232 102 aa7.9□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W YDR114CQ04597 100 aa7.9□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W AIM45Q12480 344 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
BRR1YPR057W CPR5P35176 225 aa7.89□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W YKL162CP36052 402 aa7.89□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W SHM2P37291 469 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W PCL7P40186 285 aa7.89□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W DMA2P53924 522 aa7.89□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W APJ1P53940 528 aa7.89□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W YCL001W-AP87012 153 aa7.89□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W SED1Q01589 338 aa7.89□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W YMR082CQ04276 118 aa7.89□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W YFH1Q07540 174 aa7.89□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W HRD1Q08109 551 aa7.89□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W RFM1Q12192 310 aa7.89□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W COA2Q3E823 68 aa7.89□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W RPL39P04650 51 aa7.88□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W ECM25P32525 599 aa7.88□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W SRB6P32570 121 aa7.88□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W CBT1P36038 271 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W PRS3P38689 320 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W IKI1P38874 309 aa7.88□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W CWC25P53854 179 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W TIM11P81449 96 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W YML108WQ03759 105 aa7.88□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W HOF1Q05080 669 aa7.88□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W YBR255C-AQ3E776 120 aa7.88□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W TOR1P35169 2470 aa7.87□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W LSB5P25369 354 aa7.87□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W DAL80P26343 269 aa7.87□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W ERV1P27882 189 aa7.87□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W GAR1P28007 205 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W LDS1P31379 325 aa7.87□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W REC104P33323 182 aa7.87□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W YKL107WP34251 309 aa7.87□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W XPT1P47165 209 aa7.87□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W FMP41P53889 259 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W ATG5Q12380 294 aa7.87□□□□□ -1.15
BRR1YPR057W BOL1Q3E793 110 aa7.87□□□□□ -1.15
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