RNA–Protein interactions for RNA: YLL013C

PUF3, Transcript of Protein of the mitochondrial outer surface, yeast

Gene PUF3, Length 2,640 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUF3	YLL013C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	MBA1	P38300	278 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	YML018C	Q03730	393 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	SOG2	Q08817	791 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	YCR061W	P25639	631 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	PCL7	P40186	285 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	YFL054C	P43549	646 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	DIE2	P50076	525 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	LPP1	Q04396	274 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	DAL4	Q04895	635 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	MED4	Q12343	284 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	JID1	Q12350	301 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PUF3	YLL013C	CKA1	P15790	372 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	REC104	P33323	182 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	CUE1	P38428	203 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	HPA3	P39979	161 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	FCY21	P40039	528 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	PRM5	P40476	318 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	YNL234W	P53857	426 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	MRP20	P32387	263 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	YUH1	P35127	236 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	YHR122W	P38829	231 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	IKI1	P38874	309 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	SER2	P42941	309 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	STD1	Q02794	444 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	FMP42	Q04991	504 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	UBA3	Q99344	299 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	YJL118W	P47022	219 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	IRC18	P47056	224 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	YFH1	Q07540	174 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	YOR292C	Q08743	309 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	SEN2	P16658	377 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	PUP1	P25043	261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	YHK8	P38776	514 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	MIT1	P40002	666 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	AGE2	P40529	298 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	RSM27	P53305	110 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	SPG4	Q04438	115 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	YPL199C	Q08954	240 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	GAL1	P04385	528 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	PET20	Q99373	253 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	FMT1	P32785	401 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	AIM25	P47140	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	MEH1	Q02205	184 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	SRY1	P36007	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	MRPL22	P53881	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	ASM4	Q05166	528 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	RPN13	O13563	156 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	CDC23	P16522	626 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	SPS18	P32572	300 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	MCH1	Q07376	486 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	AEP3	Q12089	606 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	ROX3	P25046	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	YKL075C	P36083	450 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	COS8	P38723	381 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	POP2	P39008	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	SCP1	Q08873	200 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	YMR31	P19955	123 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	INO2	P26798	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	POP8	P38208	133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	PHM8	P40025	321 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	CAB5	Q03941	241 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	NDE2	Q07500	545 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	FIP1	P45976	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUF3	YLL013C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67

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