RNA–Protein interactions for RNA: YKR106W

GEX2, Transcript of Proton:glutathione antiporter, yeast

Gene GEX2, Length 1,848 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GEX2	YKR106W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.22	□□□□□ -1.57	not detected
GEX2	YKR106W	YHR035W	P38769	630 aa		5.22	□□□□□ -1.57
GEX2	YKR106W	MOB1	P40484	314 aa		5.22	□□□□□ -1.57
GEX2	YKR106W	RPA43	P46669	326 aa		5.22	□□□□□ -1.57
GEX2	YKR106W	MSY1	P48527	492 aa		5.22	□□□□□ -1.57
GEX2	YKR106W	EMC4	P53073	190 aa		5.22	□□□□□ -1.57
GEX2	YKR106W	VPS28	Q02767	242 aa		5.22	□□□□□ -1.57
GEX2	YKR106W	ASR1	Q06834	288 aa		5.22	□□□□□ -1.57
GEX2	YKR106W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
GEX2	YKR106W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	SEC22	P22214	214 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	PPH21	P23594	369 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	IES6	P32617	166 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	FLO10	P36170	1169 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	UBC7	Q02159	165 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	NRG1	Q03125	231 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	TMA23	Q03525	211 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	YLR346C	Q06139	101 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	YLR415C	O13578	112 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	VAR1	P02381	398 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	OCH1	P31755	480 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	SRB6	P32570	121 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	MBB1	P39534	108 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	YPS6	P40583	537 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	ATG18	P43601	500 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	ASI3	P53983	676 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	RNH202	Q05635	350 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	MET32	Q12041	191 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	RNH203	Q12338	110 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	PCC1	Q3E833	88 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	MRP49	P32388	137 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	TRS65	P32893	560 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	YBR063C	P38083	404 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	DOG2	P38773	246 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	NSG1	P38837	291 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	HPA3	P39979	161 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	HEM14	P40012	539 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	GWT1	P47026	490 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	ELC1	Q03071	99 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	CYC3	P06182	269 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	CPT1	P17898	393 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	MKK1	P32490	508 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	PHO90	P39535	881 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	AZF1	P41696	914 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	CHA4	P43634	648 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	YJR012C	P47087	207 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	BNA5	Q05979	453 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	SEI1	Q06058	285 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	SOR2	Q07786	357 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	COX1	P00401	534 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	HAP3	P13434	144 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	PHO80	P20052	293 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	MSN2	P33748	704 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	GGC1	P38988	300 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	SNM1	P40993	198 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	DAN1	P47178	298 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	NUP57	P48837	541 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	ABF2	Q02486	183 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	MRPS16	Q02608	121 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	PLB3	Q08108	686 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	SIR2	P06700	562 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	CHO1	P08456	276 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	SHE1	P38200	338 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	YIL060W	P40519	144 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	LST7	P53237	242 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	ERV29	P53337	310 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	CRZ1	P53968	678 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	AIM34	Q03673	198 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	UPS3	Q04006	179 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	LDS2	Q08218	356 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	BSC1	Q12140	328 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	RDI1	Q12434	202 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	RPL12B	P0CX54	165 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GEX2	YKR106W	STE4	P18851	423 aa		5.17	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.6 ms