RNA–Protein interactions for RNA: YJL104W

PAM16, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM16, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM16	YJL104W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	RFC3	P38629	340 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	TCD1	P38756	429 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YHK8	P38776	514 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	TRM5	P38793	499 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	COX15	P40086	486 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	TIR3	P40552	269 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	NAS2	P40555	220 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	INA22	P40576	216 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	HXT14	P42833	540 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	STB1	P42845	420 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	GON7	P46984	123 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	NUP57	P48837	541 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YKR005C	Q02203	525 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	LCL1	Q02786	101 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	SPO19	Q03029	223 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YMR102C	Q03177	834 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	BNA7	Q04066	261 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YLR345W	Q06137	509 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YDL121C	Q07541	149 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YPD1	Q07688	167 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YOL019W	Q08157	551 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	MIM1	Q08176	113 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	DCI1	Q08558	271 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	UAF30	Q08747	228 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	FCY1	Q12178	158 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	VAM3	Q12241	283 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	SFM1	Q12314	213 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	ORT1	Q12375	292 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	RPN6	Q12377	434 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	SNF8	Q12483	233 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	SAS5	Q99314	248 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	ATG40	Q99325	256 aa		0.69	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YPR096C	O13587	100 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	GAL1	P04385	528 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	RHO2	P06781	192 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YDR034C-A	P0C289	58 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	STE18	P18852	110 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	PHO13	P19881	312 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	IFM1	P25038	676 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YCR001W	P25347	104 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	CAF4	P36130	643 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	QDR3	P38227	689 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YBR137W	P38276	179 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	PHO89	P38361	574 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	GEP4	P38812	185 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	OXA1	P39952	402 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YNL194C	P40169	301 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	SPC1	P46965	94 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	TOS2	P50078	622 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	CAX4	P53223	239 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YGR168C	P53293	376 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	CPD1	P53314	239 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	VPS75	P53853	264 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	SLM2	P53955	656 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	NUP49	Q02199	472 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YMR209C	Q03648	457 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YMR155W	Q03795	547 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	LPP1	Q04396	274 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	MRX8	Q05473	314 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	UPS1	Q05776	175 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	COA4	Q05809	96 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	NEJ1	Q06148	342 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YPR127W	Q06494	345 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YPL162C	Q12042	273 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YOR029W	Q12243	111 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	EAF3	Q12432	401 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.68	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	COX5B	P00425	151 aa		0.67	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	SIR2	P06700	562 aa		0.67	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	STF2	P16965	84 aa		0.67	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	ZRC1	P20107	442 aa		0.67	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	RHB1	P25378	209 aa		0.67	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	ATG22	P25568	528 aa		0.67	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	PHO91	P27514	894 aa		0.67	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	OAC1	P32332	324 aa		0.67	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	0.67	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	ETR1	P38071	380 aa		0.67	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	SVP26	P38869	228 aa		0.67	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
PAM16	YJL104W	AVT6	P40074	448 aa		0.67	□□□□□ -2.3

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