RNA–Protein interactions for RNA: YHR139C

SPS100, Transcript of Protein required for spore wall maturation, yeast

Gene SPS100, Length 981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPS100	YHR139C	MEH1	Q02205	184 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	SWT1	Q12104	458 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	BBP1	Q12365	385 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	ARG80	P07249	177 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	GCN3	P14741	305 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	TCA17	P32613	152 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	BOL3	P39724	118 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	ABM1	P47146	123 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	YGL262W	P53054	175 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	THI74	Q04083	370 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	FEX2	Q08991	375 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	DGK1	Q12382	290 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	SUA5	P32579	426 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	MIA40	P36046	403 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.23	□□□□□ -1.25	not detected
SPS100	YHR139C	SSO2	P39926	295 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	UBP8	P50102	471 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	NIF3	P53081	288 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	YOR292C	Q08743	309 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	PRM4	Q12498	284 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	PUT1	P09368	476 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	RRF1	P38771	230 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	PCL7	P40186	285 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	YGR210C	P42942	411 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	WSC2	P53832	503 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	ASM4	Q05166	528 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	SOR2	Q07786	357 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	YLR125W	Q12138	136 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	TFC7	Q12415	435 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.25
SPS100	YHR139C	QCR2	P07257	368 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	LSB5	P25369	354 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	MRP20	P32387	263 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	VMA11	P32842	164 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	YGL015C	P33199	130 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	REC104	P33323	182 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	IKI1	P38874	309 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	IRC24	P40580	263 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	YFL015C	P43578	164 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	YGL114W	P53134	725 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	YDL086W	Q07505	273 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	YFH1	Q07540	174 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	FEX1	Q08913	375 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	ALG14	P38242	237 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	CUE1	P38428	203 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	ARR2	Q06597	130 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	ERG2	P32352	222 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	YPC1	P38298	316 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	YOL029C	Q08187	201 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	COQ2	P32378	372 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	SRL3	P36167	246 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	LPP1	Q04396	274 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	YPD1	Q07688	167 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	YCT1	Q12235	531 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	YOS1	Q3E834	85 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	ROX3	P25046	220 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	ACB1	P31787	87 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	YIR035C	P40579	254 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	VPS28	Q02767	242 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	HRD1	Q08109	551 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	ERV15	P38312	142 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	YGR045C	P53229	120 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	APJ1	P53940	528 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	YMR317W	Q04893	1140 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	YPR071W	Q12346	211 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	BOL1	Q3E793	110 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	YMR31	P19955	123 aa		7.15	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	YJL118W	P47022	219 aa		7.15	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	PAM18	Q07914	168 aa		7.15	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
SPS100	YHR139C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
SPS100	YHR139C	YCR061W	P25639	631 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SPS100	YHR139C	RPB9	P27999	122 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SPS100	YHR139C	SPS18	P32572	300 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SPS100	YHR139C	PMU1	P36069	295 aa		7.14	□□□□□ -1.27

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