RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	ARA2	Q04212	335 aa		3.24	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	SOR2	Q07786	357 aa		3.24	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	PER33	Q12144	273 aa		3.24	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	UBR2	Q07963	1872 aa		3.24	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	HEM2	P05373	342 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	CYC3	P06182	269 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	PPA2	P28239	310 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	ATS1	P31386	333 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	UTR2	P32623	467 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YSC83	P32792	385 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	SAF1	P38352	637 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YHL041W	P38730	149 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	ATG27	P46989	271 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	SFH5	P47008	294 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	PDR17	P53844	350 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	THI74	Q04083	370 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	PRM3	Q08931	133 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YPR015C	Q12531	247 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	INO4	P13902	151 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	COX10	P21592	462 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	DUT1	P33317	147 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	THI80	P35202	319 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	TRR2	P38816	342 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	PEX7	P39108	375 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	MAF1	P41910	395 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	HIT1	P46973	164 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	TTI2	P47168	421 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	SCS3	P53012	380 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	ERG25	P53045	309 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	IRC15	Q02733	499 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	PAM18	Q07914	168 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	NRT1	Q08485	598 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	MCT1	Q12283	360 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	IZH2	Q12442	317 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	RAX2	Q12465	1220 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YOS1	Q3E834	85 aa		3.23	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	COX1	P00401	534 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	MSS51	P32335	436 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	SLC1	P33333	303 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	DRE2	P36152	348 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	CTF8	P38877	133 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	HSP10	P38910	106 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	PIC2	P40035	300 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YNL198C	P40166	100 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	MTM1	P53320	366 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	IBD2	P53892	351 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YLR460C	P54007	376 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	AIM34	Q03673	198 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	TSA2	Q04120	196 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	DIC1	Q06143	298 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	TAZ1	Q06510	381 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	SUE1	Q06524	206 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	BSC1	Q12140	328 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	POM34	Q12445	299 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	GPI12	P23797	304 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	CWP1	P28319	239 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	NNK1	P36003	928 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YBR071W	P38243	211 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	UMP1	P38293	148 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YAL037W	P39728	267 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	ERG28	P40030	148 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	PAM16	P42949	149 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	SNO3	P43544	222 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	SNO2	P53823	222 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YNL018C	P53976	612 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	ADD37	Q03233	198 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YML053C	Q04978	212 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	PFA4	Q12006	378 aa		3.22	□□□□□ -1.89
XRS2	YDR369C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
XRS2	YDR369C	POX1	P13711	748 aa		3.21	□□□□□ -1.9
XRS2	YDR369C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
XRS2	YDR369C	ESS1	P22696	170 aa		3.21	□□□□□ -1.9
XRS2	YDR369C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.21	□□□□□ -1.9	not detected
XRS2	YDR369C	GCS1	P35197	352 aa		3.21	□□□□□ -1.9
XRS2	YDR369C	YER076C	P40049	302 aa		3.21	□□□□□ -1.9
XRS2	YDR369C	COQ5	P49017	307 aa		3.21	□□□□□ -1.9
XRS2	YDR369C	NPY1	P53164	384 aa		3.21	□□□□□ -1.9
XRS2	YDR369C	PAU12	P53343	120 aa		3.21	□□□□□ -1.9
XRS2	YDR369C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
XRS2	YDR369C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9

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