RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W NAT4Q04751 285 aa4.05□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W TAZ1Q06510 381 aa4.05□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W RRT7Q07829 113 aa4.05□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W YPK2P18961 677 aa4.04□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W GGC1P38988 300 aa4.04□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W SOL1P50278 321 aa4.04□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W EST3Q03096 181 aa4.04□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W BER1Q06688 274 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W CMC2Q3E7A4 109 aa4.04□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W CCH1P50077 2039 aa4.04□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W SDH4P37298 181 aa4.04□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W YBR013CP38215 129 aa4.04□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W ICE2P40499 491 aa4.04□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W ERV14P53173 138 aa4.04□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W BOR1P53838 576 aa4.04□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W YMR253CQ04835 414 aa4.04□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W SDO1Q07953 250 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W YOR385WQ08909 290 aa4.04□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W MMT2Q08970 484 aa4.04□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W ODC2Q99297 307 aa4.04□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W SPT10P35208 640 aa4.03□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W COS9P36034 407 aa4.03□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W GIM4P40005 111 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W CIN2P46670 268 aa4.03□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W SFH5P47008 294 aa4.03□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W YJR056CP47115 236 aa4.03□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W VEL1P53058 206 aa4.03□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W YGL101WP53144 215 aa4.03□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W PNC1P53184 216 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W STE7P06784 515 aa4.03□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W COX9P07255 59 aa4.03□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W YSR3P23501 404 aa4.03□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data4.03□□□□□ -1.76not detected
PRD1YCL057W LSM4P40070 187 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W AAH1P53909 347 aa4.03□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W PML1Q07930 204 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PRD1YCL057W NTF2P33331 125 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W UIP5P36137 443 aa4.02□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W AIM24P47127 394 aa4.02□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W YGL185CP53100 379 aa4.02□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W ACT1P60010 375 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W STD1Q02794 444 aa4.02□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W INP1Q03694 420 aa4.02□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W CCE1Q03702 353 aa4.02□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W YLR146W-AQ2V2P1 62 aa4.02□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa4.02□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W CLB6P32943 380 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W SNC2P33328 115 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W AVT5P38176 459 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W SDS24P38314 527 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W TRR2P38816 342 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W SIM1P40472 476 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W ADO1P47143 340 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W TIM21P53220 239 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W YNR062CP53748 327 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W PDR16P53860 351 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W CTF19Q02732 369 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W YPD1Q07688 167 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W TPT1Q12272 230 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W ADH3P07246 375 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W SGA1P08019 549 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W PPH21P23594 369 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W YCR101CP25607 182 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W MRPL28P36527 147 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W POP8P38208 133 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W QDR3P38227 689 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W YER079WP40052 210 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W YGL114WP53134 725 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W ADD37Q03233 198 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W FIT1Q04433 528 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W YDL211CQ12121 372 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W ERV2Q12284 196 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W RNH203Q12338 110 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W AHC1Q12433 566 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W YDR524C-BQ3E6R4 66 aa4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W CDC7P06243 507 aa4□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W SEC59P20048 519 aa4□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W SCL1P21243 252 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W MRS4P23500 304 aa4□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data4□□□□□ -1.77not detected
PRD1YCL057W SMB1P40018 196 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W YIL067CP40514 678 aa4□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W NAS2P40555 220 aa4□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W SYS1P41544 203 aa4□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W YFL067WP43537 175 aa4□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W YGL204CP53089 101 aa4□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W GIM3P53900 129 aa4□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W APJ1P53940 528 aa4□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W SMA2Q04658 369 aa4□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W HEM25Q07534 307 aa4□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W BRX1Q08235 291 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PRD1YCL057W COX19Q3E731 98 aa4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 123.8 ms