RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	PET18	P25362	215 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YCR101C	P25607	182 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	ERG3	P32353	365 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	RNP1	P32385	249 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	TCA17	P32613	152 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	PPG1	P32838	368 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	MRPS5	P33759	307 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	UMP1	P38293	148 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	UBC13	P52490	153 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YDC1	Q02896	317 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	PIN3	Q06449	215 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	MAK32	P23060	363 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	ATG22	P25568	528 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	MRP17	P28778	131 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	REC114	P32841	428 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YKL063C	P35725	167 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YBR220C	P38318	560 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YND1	P40009	630 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	FLX1	P40464	311 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	BMT5	P40493	336 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	SSN8	P47821	323 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	MRPL50	P53724	139 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	HHT1	P61830	136 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YDR248C	Q03786	193 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	HEM25	Q07534	307 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	GRC3	Q07845	632 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YOR385W	Q08909	290 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	MED4	Q12343	284 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	POM34	Q12445	299 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	PET20	Q99373	253 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	COX5B	P00425	151 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	ACH1	P32316	526 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	SUA5	P32579	426 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	FLO10	P36170	1169 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	FAT1	P38225	669 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.19	□□□□□ -1.74	RIP-Chip
TRM10	YOL093W	OTU1	P43558	301 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	MRX5	P47007	382 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	DIE2	P50076	525 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YIP5	P53108	310 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YGR151C	P53287	111 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YML018C	Q03730	393 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	CAB5	Q03941	241 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	VBA1	Q04301	562 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	UPS1	Q05776	175 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	HUT1	Q12520	339 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	ATG40	Q99325	256 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	SAG1	P20840	650 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	IFM1	P25038	676 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	PEX4	P29340	183 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	MRPL36	P36531	177 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	COS8	P38723	381 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	MTC6	P38849	526 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	BUD8	P41698	603 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	EGT2	P42835	1041 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	CRZ1	P53968	678 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	GMC1	Q04399	608 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	SCP1	Q08873	200 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	VAM3	Q12241	283 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	RNH203	Q12338	110 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	EAF3	Q12432	401 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	UBA3	Q99344	299 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	REP2	P03872	296 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	ARG80	P07249	177 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	PCL1	P24867	279 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	ATG15	P25641	520 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	FMT1	P32785	401 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	PPQ1	P32945	549 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	PAC2	P39937	518 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	YER121W	P40076	114 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	ECM27	P47144	725 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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