RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W SCW10Q04951 389 aa2.4□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W SPO77Q06134 477 aa2.4□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W SNA4Q07549 140 aa2.4□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W PET494P07390 489 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W SEN2P16658 377 aa2.4□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W BMH1P29311 267 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YNL194CP40169 301 aa2.4□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W COA1P40452 197 aa2.4□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YIL029CP40538 142 aa2.4□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W ASI3P53983 676 aa2.4□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W TIM44Q01852 431 aa2.4□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YPL062WQ02781 134 aa2.4□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W SWP1Q02795 286 aa2.4□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W DTD1Q07648 150 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W RIB1P38066 345 aa2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YBR013CP38215 129 aa2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W AST2P39945 430 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W SNX4P47057 423 aa2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W MIG2P53035 382 aa2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YGR042WP53227 271 aa2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W NUP100Q02629 959 aa2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W NAT4Q04751 285 aa2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W TRM13Q12383 476 aa2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YOP1Q12402 180 aa2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W HYP2P23301 157 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W PGU1P47180 361 aa2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YDR476CQ03362 224 aa2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W UTP23Q12339 254 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W MES1P00958 751 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YOX1P34161 385 aa2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YKL063CP35725 167 aa2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YIL169CP40442 995 aa2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W MRM2P53123 320 aa2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YLR031WQ07978 186 aa2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W RRS1Q08746 203 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W ALG7P07286 448 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YCR041WP37265 110 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W ARN1P38731 627 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W GEP4P38812 185 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W KEG1P43614 200 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W RPE1P46969 238 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YDC1Q02896 317 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W ORM2Q06144 216 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W THI72Q08579 599 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W APC9Q12107 265 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W NCA2Q12374 616 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W CPR5P35176 225 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W BRR6P53062 197 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W CTF19Q02732 369 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W LCL1Q02786 101 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W HRD1Q08109 551 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W SNF8Q12483 233 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W DFM1Q12743 341 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YPR010C-AA5Z2X5 72 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YAR1P46683 200 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W FMP33P46998 180 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W GOT1Q03554 138 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YDL114WQ07530 308 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YAP7Q08182 245 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YAL064W-BO13512 126 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W ADH2P00331 348 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W RPL12BP0CX54 165 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W NDC1P32500 655 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W RGI1P40043 161 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W MRPL22P53881 309 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YPL080CQ02826 108 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W NEJ1Q06148 342 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W RNH203Q12338 110 aa2.38□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W ERG28P40030 148 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W MAM33P40513 266 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W MIC26P50087 233 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W FYV6P53913 173 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W SED1Q01589 338 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YPR098CQ06089 161 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YPR064WQ12492 139 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W TRR1P29509 319 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W OCH1P31755 480 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W MSS1P32559 526 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W VMA11P32842 164 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W PPZ2P33329 710 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W CIN2P46670 268 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W XPT1P47165 209 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YGR015CP53208 328 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YDR274CP87283 123 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W NKP2Q06162 153 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W TOM1Q03280 3268 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W IMA3P0CW40 589 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W IMA4P0CW41 589 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W LSB5P25369 354 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W AGA2P32781 87 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YGL204CP53089 101 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W OKP1P53298 406 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W CTL1Q03220 320 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W HOR7Q05827 59 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W IMA2Q08295 589 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
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