RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL204CP53089 101 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR054WP53235 642 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J OKP1P53298 406 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J CWC25P53854 179 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL234WP53857 426 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J HSK3P69852 69 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SRL4Q03085 281 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J TLG1Q03322 224 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J MDM36Q06820 579 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J MRX9Q07349 420 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR186WQ08560 144 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR071WQ12346 211 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J JID1Q12350 301 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ATO3Q12359 275 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ORT1Q12375 292 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J WHI5Q12416 295 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YOS1Q3E834 85 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG40Q99325 256 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J VCX1Q99385 411 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J GCN4P03069 281 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J RAD52P06778 471 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J PHO85P17157 305 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J VMA3P25515 160 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J BUD23P25627 275 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J AHC2P25649 128 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ARO4P32449 370 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ERG24P32462 438 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SFK1P35735 353 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J EDS1P38073 919 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J CCZ1P38273 704 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J NVJ1P38881 321 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J PDS1P40316 373 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J MSS2P40990 351 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J BUD8P41698 603 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J FIP1P45976 327 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J MRX5P47007 382 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J TAX4P47030 604 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ILM1P47155 203 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J XPT1P47165 209 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J DOC1P53068 250 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SCW4P53334 386 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS71Q03433 280 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J FIT1Q04433 528 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J GRC3Q07845 632 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YOL118CQ08259 102 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J AEP3Q12089 606 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J RBD2Q12270 262 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR122CQ12312 125 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J FRE6Q12473 712 aa2.13□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J DYN1P36022 4092 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ADE8P04161 214 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC31P06704 161 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J COX9P07255 59 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J MATALPHA1P0CY06 175 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J HMLALPHA1P0CY07 175 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J MRP1P10662 321 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J MRS4P23500 304 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG22P25568 528 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J FEN2P25621 512 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ERG3P32353 365 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J RPD3P32561 433 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J PAU2P32612 120 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ISC10P32645 267 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SOR1P35497 357 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J PRY2P36110 329 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J CUE1P38428 203 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J PRS2P38620 318 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J PRE3P38624 215 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YLF2P38746 405 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J TIF11P38912 153 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J MID1P41821 548 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J GNA1P43577 159 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J WWM1P43582 211 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J GPI14P47088 403 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J BNA1P47096 177 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J EFM3P47163 339 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J BXI1P48558 297 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J IMO32P53219 342 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR042WP53227 271 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SLX9P53251 210 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J CTF19Q02732 369 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J HED1Q03937 162 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J UPS1Q05776 175 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J NDE2Q07500 545 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YDL086WQ07505 273 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SOR2Q07786 357 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SWT1Q12104 458 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J TAF3Q12297 353 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J TRM10Q12400 293 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J MED11Q99278 115 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ODC2Q99297 307 aa2.12□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS31P05759 152 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J HIS3P06633 220 aa2.11□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data2.11□□□□□ -2.07not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J OLE1P21147 510 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
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