RNA–Protein interactions for RNA: YPR080W

TEF1, Transcript of Translational elongation factor EF-1 alpha, yeast

Gene TEF1, Length 1,377 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TEF1	YPR080W	SGA1	P08019	549 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	MET3	P08536	511 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	HNM1	P19807	563 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	ERG3	P32353	365 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	KAE1	P36132	386 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	LAG1	P38703	411 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	VMA7	P39111	118 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	NIF3	P53081	288 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	TYW3	P53177	273 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	RPN14	P53196	417 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	BUD25	P85052	153 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
TEF1	YPR080W	COA4	Q05809	96 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	ATG31	Q12421	196 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	GAL1	P04385	528 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	YCR101C	P25607	182 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	GEP4	P38812	185 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	YML018C	Q03730	393 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	RAF1	Q06891	181 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	SCP1	Q08873	200 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	MED4	Q12343	284 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	ISN1	Q99312	450 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	YBL010C	P32788	280 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	REC114	P32841	428 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	YBR197C	P38306	217 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	YEL057C	P39983	233 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	YIL169C	P40442	995 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	PRM5	P40476	318 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	XBP1	P40489	647 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	YIL029C	P40538	142 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	RCE1	Q03530	315 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	YDR248C	Q03786	193 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	YAP6	Q03935	383 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	CAB5	Q03941	241 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	FEX1	Q08913	375 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	VAM3	Q12241	283 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	ERP4	Q12450	207 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	HUT1	Q12520	339 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	COX5B	P00425	151 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	YCR061W	P25639	631 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	POP8	P38208	133 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	YND1	P40009	630 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	YER084W	P40057	128 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	BMT5	P40493	336 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	YGR210C	P42942	411 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	SSN8	P47821	323 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	PHB2	P50085	310 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	UBC12	P52491	188 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	YIP5	P53108	310 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	AEP3	Q12089	606 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
TEF1	YPR080W	BBP1	Q12365	385 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	FMP16	Q12497	93 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	UBA3	Q99344	299 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	SEN2	P16658	377 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	MRPL33	P20084	86 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	SAG1	P20840	650 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	VMA3	P25515	160 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	ISC10	P32645	267 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	MCH2	P36032	473 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	NAT2	P37293	288 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	FAT1	P38225	669 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	ATF1	P40353	525 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	MRX5	P47007	382 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TEF1	YPR080W	GWT1	P47026	490 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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