RNA–Protein interactions for RNA: YKR067W

GPT2, Transcript of Glycerol-3-phosphate/dihydroxyacetone phosphate sn-1 acyltransferase, yeast

Gene GPT2, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GPT2	YKR067W	CYC3	P06182	269 aa		5.23	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	ALG7	P07286	448 aa		5.23	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	RPB8	P20436	146 aa		5.23	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	EPT1	P22140	391 aa		5.23	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	SEC22	P22214	214 aa		5.23	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.23	□□□□□ -1.57	not detected
GPT2	YKR067W	NUP2	P32499	720 aa		5.23	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	INM1	P38710	295 aa		5.23	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	YHR078W	P38799	552 aa		5.23	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	YFR020W	P43600	232 aa		5.23	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	POS5	Q06892	414 aa		5.23	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		5.23	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	PHO2	P07269	559 aa		5.22	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	YCR102C	P25608	368 aa		5.22	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	SPT14	P32363	452 aa		5.22	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	YEF1	P32622	495 aa		5.22	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	MRPL6	P32904	214 aa		5.22	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	TIR2	P33890	251 aa		5.22	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	YNR062C	P53748	327 aa		5.22	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	CYK3	Q07533	885 aa		5.22	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	SIA1	Q12212	622 aa		5.22	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	AHC2	P25649	128 aa		5.21	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	SLM6	P38343	150 aa		5.21	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	GCV1	P48015	400 aa		5.21	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	MMS2	P53152	137 aa		5.21	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	SWC4	P53201	476 aa		5.21	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	POP6	P53218	158 aa		5.21	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	IGO1	P53897	168 aa		5.21	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	PEX27	Q08580	376 aa		5.21	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	MCA1	Q08601	432 aa		5.21	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	YDL199C	Q12407	687 aa		5.21	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	RAX2	Q12465	1220 aa		5.21	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	PRM4	Q12498	284 aa		5.21	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	ACH1	P32316	526 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	GMH1	P36125	273 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	FRM2	P37261	193 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	VMA7	P39111	118 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	RPA43	P46669	326 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	IKS1	P47042	667 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	UBX6	P47049	396 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	FLC3	P53121	802 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	APS2	Q00381	147 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	NAT4	Q04751	285 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	YBR085C-A	O43137	85 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	YLL053C	P0CD98	152 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	YPT53	P36019	220 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	YAL037W	P39728	267 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	MIC26	P50087	233 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	EXG2	P52911	562 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	PRM8	P53174	237 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	ALG13	P53178	202 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	IRC15	Q02733	499 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	ODC1	Q03028	310 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	DLT1	Q04216	342 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	GTT2	Q12390	233 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	MED11	Q99278	115 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	STT4	P37297	1900 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	RPN13	O13563	156 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	YPR096C	O13587	100 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	RNP1	P32385	249 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	MRP49	P32388	137 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	QDR3	P38227	689 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	CHL4	P38907	458 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	FMP52	P40008	231 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	MDM34	P53083	459 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	TMA23	Q03525	211 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	ROT1	Q03691	256 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	YMR320W	Q04897	101 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	TDA6	Q06466	467 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	ATG10	Q07879	167 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	MED7	Q08278	222 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	POM34	Q12445	299 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	TEL1	P38110	2787 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	SPS18	P32572	300 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GPT2	YKR067W	REC114	P32841	428 aa		5.19	□□□□□ -1.58

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