RNA–Protein interactions for RNA: YGL008C

PMA1, Transcript of Plasma membrane P2-type H+-ATPase, yeast

Gene PMA1, Length 2,757 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMA1	YGL008C	DML1	Q03652	475 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	SNX41	Q04053	625 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	YMR320W	Q04897	101 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	ICT1	Q12385	394 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	MRS1	P07266	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	HSP30	P25619	332 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	URA10	P30402	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	KRE29	P40026	464 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	GLC8	P41818	229 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	FRE4	P53746	719 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	SCS7	Q03529	384 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	UBR1	P19812	1950 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	DBF2	P22204	572 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	PHA2	P32452	334 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	CPR5	P35176	225 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	SPC34	P36131	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	CUE1	P38428	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	MDM31	P38880	579 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	RBG1	P39729	369 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	YIP1	P53039	248 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	TIM44	Q01852	431 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	TRM10	Q12400	293 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	MRX4	Q12467	430 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	FLO11	P08640	1367 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	SDH3	P33421	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	TOD6	P34219	525 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	APL3	P38065	1025 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	YJR012C	P47087	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	PRM8	P53174	237 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	DID2	P69771	204 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	YDR209C	Q03480	137 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	MAK3	Q03503	176 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	THI72	Q08579	599 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	RFM1	Q12192	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	LSB5	P25369	354 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	RMD6	P39975	231 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	ARG2	P40360	574 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	JJJ3	P47138	172 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	MCM22	P47167	239 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	IBD2	P53892	351 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	YMD8	Q03697	442 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	CTR3	Q06686	241 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	COX4	P04037	155 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	KIN28	P06242	306 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	PPH21	P23594	369 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	YCR006C	P25350	157 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	YEF1	P32622	495 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	TIR3	P40552	269 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	SEI1	Q06058	285 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	YLR046C	Q12253	270 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	GTT2	Q12390	233 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	MDM10	P18409	493 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	YMC2	P38087	329 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	AIM23	P47015	356 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	YDL199C	Q12407	687 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PMA1	YGL008C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
PMA1	YGL008C	KAE1	P36132	386 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	ROT2	P38138	954 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	SDS24	P38314	527 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	GTR2	P53290	341 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	ASI3	P53983	676 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	YPL247C	Q12523	523 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	SFK1	P35735	353 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	ECM14	P38836	430 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	PET8	P38921	284 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	FIS1	P40515	155 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	YPS5	P53057	165 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	SWC4	P53201	476 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	CBP4	P37267	147 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected
PMA1	YGL008C	SOL4	P53315	255 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	YDR249C	Q03787	373 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PMA1	YGL008C	HPF1	Q05164	967 aa		4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 51.7 ms