RNA–Protein interactions for RNA: YDL069C

CBS1, Mitochondrial translational activator of the COB mRNA, yeast

Gene CBS1, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBS1	YDL069C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		0.66	□□□□□ -2.3
CBS1	YDL069C	VAR1	P02381	398 aa		0.65	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	0.65	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	COA1	P40452	197 aa		0.65	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	HEM25	Q07534	307 aa		0.65	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	YKR104W	P0CE69	306 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	SNA3	P14359	133 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	OPI1	P21957	404 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	QRI5	P32344	111 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	YKL070W	P36087	169 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	MRPL39	P36533	70 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	MRPL40	P36534	297 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	MRX3	P38172	270 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	SNZ3	P43545	298 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	ATG39	Q06159	398 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	YLR413W	Q06689	675 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	QCR8	P08525	94 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	KAP114	P53067	1004 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	YPR172W	Q06608	200 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	COQ10	Q08058	207 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	YOR186W	Q08560	144 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	TPO4	Q12256	659 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	OST6	Q03723	332 aa		0.62	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	SPG4	Q04438	115 aa		0.62	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		0.61	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	KDX1	P36005	433 aa		0.61	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	JEN1	P36035	616 aa		0.61	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	TIR3	P40552	269 aa		0.61	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	YJR056C	P47115	236 aa		0.61	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	YPL162C	Q12042	273 aa		0.61	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		0.61	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	YAR068W	P39564	161 aa		0.6	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	YPR098C	Q06089	161 aa		0.6	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	YCT1	Q12235	531 aa		0.6	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	SGE1	P33335	543 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	SNZ2	P53824	298 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	UBC7	Q02159	165 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		0.59	□□□□□ -2.31
CBS1	YDL069C	RSR1	P13856	272 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	EHD3	P28817	500 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	MEI4	P29467	408 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	FZF1	P32805	299 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	GOS1	P38736	223 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	RSM25	P40496	264 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	ICE2	P40499	491 aa		0.58	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	DAL80	P26343	269 aa		0.57	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	RRF1	P38771	230 aa		0.57	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	YER076C	P40049	302 aa		0.57	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	YNL217W	P40152	326 aa		0.57	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	RPA43	P46669	326 aa		0.57	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	YDR209C	Q03480	137 aa		0.57	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	COX2	P00410	251 aa		0.56	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	CDC8	P00572	216 aa		0.56	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	FCY2	P17064	533 aa		0.56	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	PGD1	P40356	397 aa		0.56	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	ILM1	P47155	203 aa		0.56	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	GPI8	P49018	411 aa		0.56	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	BOL2	P53082	120 aa		0.56	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	YNL046W	P53956	172 aa		0.56	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	YMR007W	Q03675	126 aa		0.56	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	ANT1	Q06497	328 aa		0.56	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	DAL82	P21705	255 aa		0.55	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	YBR063C	P38083	404 aa		0.55	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	YBR096W	P38256	230 aa		0.55	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	MEP1	P40260	492 aa		0.55	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	HUA1	P40325	198 aa		0.55	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	USE1	P53146	245 aa		0.55	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	SAY1	P53324	424 aa		0.55	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	0.55	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	0.55	□□□□□ -2.32
CBS1	YDL069C	PET100	P38958	111 aa		0.54	□□□□□ -2.32

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