RNA–Protein interactions for RNA: YJR104C

SOD1, Transcript of Cytosolic copper-zinc superoxide dismutase, yeast

Gene SOD1, Length 465 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOD1	YJR104C	MPM1	P40364	252 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	AYR1	P40471	297 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	EMC5	P40540	141 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	MOB2	P43563	287 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	GWT1	P47026	490 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	AVT4	P50944	713 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	MGA1	P53050	456 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	FRE4	P53746	719 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YNR066C	P53752	436 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	IBD2	P53892	351 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	AAH1	P53909	347 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	AQR1	P53943	586 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	NUP100	Q02629	959 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	STD1	Q02794	444 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	TRS23	Q03784	219 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	MSS11	Q03825	758 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	SWC7	Q06707	132 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	ATG10	Q07879	167 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	AIM39	Q08223	395 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	NRT1	Q08485	598 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	RDR1	Q08904	546 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YDR056C	Q12025	205 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YLR049C	Q12110	428 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	UPC2	Q12151	913 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	ATG5	Q12380	294 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	TRM13	Q12383	476 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YPL247C	Q12523	523 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	SLO1	Q3E784	85 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	FSH3	Q99369	266 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YOR304C-A	O14468	76 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	QCR7	P00128	127 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	UNG1	P12887	359 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.2	□□□□□ -1.9	not detected
SOD1	YJR104C	SEC22	P22214	214 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	LSB5	P25369	354 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	STP22	P25604	385 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	SEC17	P32602	292 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	COT1	P32798	439 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	PMU1	P36069	295 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YCR087C-A	P37263	153 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	RIB5	P38145	238 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	CUE1	P38428	203 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	SYS1	P41544	203 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	GAB1	P41733	394 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	SHR5	P41912	237 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	SSU1	P41930	458 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	PMT6	P42934	759 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	IKS1	P47042	667 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	OST3	P48439	350 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	EXG2	P52911	562 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	MDM34	P53083	459 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	BUD17	P53727	317 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	RSM23	Q01163	450 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	AAT1	Q01802	451 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YDR248C	Q03786	193 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	RIM13	Q03792	727 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	AVO2	Q04749	426 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	NAT4	Q04751	285 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YMR253C	Q04835	414 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	ATG39	Q06159	398 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	CNL1	Q06333	122 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	HEM25	Q07534	307 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	IZH3	Q07959	543 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	XYL2	Q07993	356 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	ATG41	Q12048	136 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	NBP2	Q12163	236 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YLR118C	Q12354	227 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	FRE6	Q12473	712 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	IZH4	Q99393	312 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	COX2	P00410	251 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	PAU19	P0CE85	124 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	PAU21	P0CE86	164 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	PAU22	P0CE87	164 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	PPH21	P23594	369 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	PAU3	P25610	124 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	POP5	P28005	173 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	AFG1	P32317	509 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	SSH4	P32343	579 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	TIP20	P33891	701 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	PRY2	P36110	329 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YBR053C	P38235	358 aa		3.19	□□□□□ -1.9

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