RNA–Protein interactions for RNA: YGR030C

POP6, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP6, Length 477 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP6	YGR030C	YDR124W	Q04608	324 aa		2.72	□□□□□ -1.97
POP6	YGR030C	YKR104W	P0CE69	306 aa		2.71	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	USE1	P53146	245 aa		2.71	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	RRN5	Q02983	363 aa		2.71	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	GOT1	Q03554	138 aa		2.71	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	TY3A-G	Q12173	290 aa		2.71	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	MSH5	Q12175	901 aa		2.71	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	TY3A-I	Q99219	290 aa		2.71	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	SNF6	P18888	332 aa		2.7	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	CLB6	P32943	380 aa		2.7	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	MRPL39	P36533	70 aa		2.7	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	FZO1	P38297	855 aa		2.7	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	COG3	P40094	801 aa		2.7	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	YJL016W	P47072	561 aa		2.7	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	YJR146W	P47174	117 aa		2.7	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	CTF19	Q02732	369 aa		2.7	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	COQ10	Q08058	207 aa		2.7	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	MED4	Q12343	284 aa		2.7	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	EHD3	P28817	500 aa		2.69	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	MRH4	P53166	561 aa		2.69	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	YGL034C	P53186	121 aa		2.69	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	MRPL50	P53724	139 aa		2.69	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	SNZ2	P53824	298 aa		2.69	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	SLM2	P53955	656 aa		2.69	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	VPS68	Q12016	184 aa		2.69	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	YBR096W	P38256	230 aa		2.68	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	GOS1	P38736	223 aa		2.68	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	SPG4	Q04438	115 aa		2.68	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	PAM18	Q07914	168 aa		2.68	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	CSM4	Q08955	156 aa		2.68	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	YCT1	Q12235	531 aa		2.68	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	SWI1	P09547	1314 aa		2.68	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	SEC22	P22214	214 aa		2.67	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	RCN1	P36054	211 aa		2.67	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	OST2	P46964	130 aa		2.67	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	CAB4	P53332	305 aa		2.67	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	PEX12	Q04370	399 aa		2.67	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	BBP1	Q12365	385 aa		2.67	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	EMP46	Q12396	444 aa		2.67	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	SAS5	Q99314	248 aa		2.67	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	YHL026C	P38740	315 aa		2.66	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.66	□□□□□ -1.98	not detected
POP6	YGR030C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	YER189W	P40104	122 aa		2.66	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	ATG31	Q12421	196 aa		2.66	□□□□□ -1.98
POP6	YGR030C	SGA1	P08019	549 aa		2.65	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	MNN5	P46982	586 aa		2.65	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	COS8	P38723	381 aa		2.64	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	FMC1	P40491	155 aa		2.64	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	SRL4	Q03085	281 aa		2.64	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	RSM10	Q03201	203 aa		2.64	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	YOR186W	Q08560	144 aa		2.64	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	YLR462W	O13556	202 aa		2.63	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	YEL075C	P39972	122 aa		2.63	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	YJR079W	P47126	109 aa		2.63	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	COS6	P53344	381 aa		2.63	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	KRE28	Q04431	385 aa		2.63	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	MSA2	P36157	363 aa		2.62	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	HOC1	P47124	396 aa		2.62	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	PET117	Q02771	107 aa		2.62	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	SCO1	P23833	295 aa		2.61	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	SCM4	P32564	187 aa		2.61	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	SRB4	P32569	687 aa		2.61	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	CCA1	P21269	546 aa		2.6	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	LDB7	P38210	180 aa		2.6	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	2.6	□□□□□ -1.99	not detected
POP6	YGR030C	SNX4	P47057	423 aa		2.6	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	YGL159W	P53110	370 aa		2.6	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	FAR8	Q05040	523 aa		2.6	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	EMC6	Q12431	108 aa		2.6	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		2.59	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	YNL046W	P53956	172 aa		2.59	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	SEI1	Q06058	285 aa		2.59	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	YLR030W	Q07967	263 aa		2.59	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	YLR126C	Q12288	251 aa		2.59	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	MHT1	Q12525	324 aa		2.59	□□□□□ -1.99
POP6	YGR030C	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
POP6	YGR030C	MRPL25	P23369	157 aa		2.58	□□□□□ -2
POP6	YGR030C	MSN4	P33749	630 aa		2.58	□□□□□ -2
POP6	YGR030C	YHR125W	P38831	101 aa		2.58	□□□□□ -2

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