RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W SAM2P19358 384 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YSR3P23501 404 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W STP22P25604 385 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W ERV1P27882 189 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W EHD3P28817 500 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data3.1□□□□□ -1.91not detected
VFA1YER128W MRPL36P36531 177 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W LDB7P38210 180 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W DBP8P38719 431 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YHL044WP38727 235 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W UME6P39001 836 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W END3P39013 349 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W HAT2P39984 401 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YMR144WP40214 342 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W SEC24P40482 926 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YIL024CP40543 189 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W GZF3P42944 551 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YFL064CP43540 174 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YJR096WP47137 282 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W MDM34P53083 459 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W GTR2P53290 341 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W TIM8P57744 87 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W ABF2Q02486 183 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W AIM34Q03673 198 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W HLR1Q04429 423 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W SEN15Q04675 128 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W ADH6Q04894 360 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W RNH202Q05635 350 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W BNA5Q05979 453 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W SEI1Q06058 285 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YLR446WQ06204 433 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W MRPL35Q06678 367 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YFH1Q07540 174 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YPR202WQ08993 238 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W USB1Q12208 290 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W RDL1Q12305 139 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W PST2Q12335 198 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YCR075W-AQ3E830 75 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W BI3Q9ZZW7 517 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YOR093CQ12275 1648 aa3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W NUP188P52593 1655 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
VFA1YER128W COX2P00410 251 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W CYC3P06182 269 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W SGA1P08019 549 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W NUC1P08466 329 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W CUP2P15315 225 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W RPB5P20434 215 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W ELO2P25358 347 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W LSB5P25369 354 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W PPZ1P26570 692 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W ARP2P32381 391 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W MRP49P32388 137 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W FMT1P32785 401 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W CAT2P32796 670 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W WBP1P33767 430 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W TIR2P33890 251 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W EHT1P38295 451 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W PSD1P39006 500 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YEL057CP39983 233 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YER189WP40104 122 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W SWM2P40342 146 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W PAN6P40459 309 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W CAK1P43568 368 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YFL015CP43578 164 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W STE24P47154 453 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W STR3P53101 465 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W TIM13P53299 105 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W TRM112P53738 135 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W EFM6P53970 246 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W DAD3P69850 94 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W TRM12Q04235 462 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W SUE1Q06524 206 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W ASR1Q06834 288 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W SHS1Q07657 551 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W DCI1Q08558 271 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W SAM4Q08985 325 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YCT1Q12235 531 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YOR029WQ12243 111 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W RDI1Q12434 202 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YLR111WQ12528 110 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YKL183C-AQ3E765 70 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W RIB3Q99258 208 aa3.09□□□□□ -1.91
VFA1YER128W YLR422WQ06409 1932 aa3.09□□□□□ -1.92
VFA1YER128W BCK1Q01389 1478 aa3.09□□□□□ -1.92
VFA1YER128W IML1P47170 1584 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W DNF3Q12674 1656 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W SUC2P00724 532 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W ADE4P04046 510 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W TPK3P05986 398 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W ILV5P06168 395 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W ANB1P19211 157 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W MCK1P21965 375 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PPH21P23594 369 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PCL2P25693 308 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W PRP45P28004 379 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W ROT2P38138 954 aa3.08□□□□□ -1.92
VFA1YER128W LSM2P38203 95 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
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