RNA–Protein interactions for RNA: YKL061W

BLI1, Transcript of Subunit of the BLOC-1 complex involved in endosomal maturation, yeast

Gene BLI1, Length 342 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLI1	YKL061W	PEX31	P53203	462 aa		0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	MAL12	P53341	584 aa		0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	YPL077C	Q02831	240 aa		0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	BOP2	Q06150	570 aa		0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	MDH2	P22133	377 aa		0.14	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	PEX4	P29340	183 aa		0.14	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	UPS2	P35200	230 aa		0.14	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	END3	P39013	349 aa		0.14	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	COX16	P47081	118 aa		0.14	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	VPS20	Q04272	221 aa		0.14	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	YLR162W	Q06235	118 aa		0.14	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	SIA1	Q12212	622 aa		0.14	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	PST1	Q12355	444 aa		0.14	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		0.14	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	YAL064W-B	O13512	126 aa		0.13	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	RCN1	P36054	211 aa		0.13	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	PRM10	P42946	383 aa		0.13	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	AGP3	P43548	558 aa		0.13	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	NBP35	P52920	328 aa		0.13	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	YGL034C	P53186	121 aa		0.13	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	SWS2	P53937	143 aa		0.13	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	PRM15	Q03262	622 aa		0.13	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	ABZ2	Q03266	374 aa		0.13	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	POM33	Q12164	279 aa		0.13	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	ATO3	Q12359	275 aa		0.13	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	Q0255	P03881	472 aa		0.12	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	SWI3	P32591	825 aa		0.12	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	UIP5	P36137	443 aa		0.12	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	AVT2	P39981	480 aa		0.12	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	SEC10	Q06245	871 aa		0.12	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	YPR011C	Q12251	326 aa		0.12	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	EMP46	Q12396	444 aa		0.12	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	RAD3	P06839	778 aa		0.11	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	UGA1	P17649	471 aa		0.11	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	GPI12	P23797	304 aa		0.11	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.11	□□□□□ -2.39	not detected
BLI1	YKL061W	SMI1	P32566	505 aa		0.11	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	TCD1	P38756	429 aa		0.11	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	PRM9	P39551	298 aa		0.11	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	ERG25	P53045	309 aa		0.11	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	YGL185C	P53100	379 aa		0.11	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	VBA1	Q04301	562 aa		0.11	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	SFH1	Q06168	426 aa		0.11	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	CUR1	Q06469	252 aa		0.11	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.11	□□□□□ -2.39	not detected
BLI1	YKL061W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	0.11	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	COX5A	P00424	153 aa		0.1	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	VAR1	P02381	398 aa		0.1	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	POF1	P25576	258 aa		0.1	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	PEX3	P28795	441 aa		0.1	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	YHR125W	P38831	101 aa		0.1	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	SHC1	P39000	512 aa		0.1	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	SSO2	P39926	295 aa		0.1	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	0.1	□□□□□ -2.39	not detected
BLI1	YKL061W	YIA6	P40556	373 aa		0.1	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	BUD25	P85052	153 aa		0.1	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	RCF1	Q03713	159 aa		0.1	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	SML1	Q04964	104 aa		0.1	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	YLR297W	Q05899	129 aa		0.1	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	ARV1	Q06541	321 aa		0.1	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	VAC14	Q06708	880 aa		0.1	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	SLD7	Q08457	257 aa		0.1	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	AKR2	Q12013	749 aa		0.1	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	BBP1	Q12365	385 aa		0.1	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	YOS9	Q99220	542 aa		0.1	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	FLO9	P39712	1322 aa		0.1	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	PET18	P25362	215 aa		0.09	□□□□□ -2.4
BLI1	YKL061W	CWP1	P28319	239 aa		0.09	□□□□□ -2.4
BLI1	YKL061W	OAC1	P32332	324 aa		0.09	□□□□□ -2.4
BLI1	YKL061W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
BLI1	YKL061W	MSA2	P36157	363 aa		0.09	□□□□□ -2.4
BLI1	YKL061W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.09	□□□□□ -2.4	RIP-Chip
BLI1	YKL061W	ERV15	P38312	142 aa		0.09	□□□□□ -2.4
BLI1	YKL061W	HIS2	P38635	335 aa		0.09	□□□□□ -2.4
BLI1	YKL061W	COS8	P38723	381 aa		0.09	□□□□□ -2.4
BLI1	YKL061W	PEX18	P38855	283 aa		0.09	□□□□□ -2.4
BLI1	YKL061W	YHR180W	P38868	163 aa		0.09	□□□□□ -2.4
BLI1	YKL061W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	0.09	□□□□□ -2.4	not detected
BLI1	YKL061W	AGE2	P40529	298 aa		0.09	□□□□□ -2.4
BLI1	YKL061W	LOH1	P47055	219 aa		0.09	□□□□□ -2.4
BLI1	YKL061W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	0.09	□□□□□ -2.4

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