RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 TRIM4Q9C037 500 aa8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 SCTRP47872 440 aa8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 RIPK1Q13546 671 aa8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 GPNMBQ14956 572 aa8.29□□□□□ -1.08
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USP4-211ENST00000485450 SPECC1Q5M775 1068 aa8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 C4orf19Q8IY42 314 aa8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 TNS4Q8IZW8 715 aa8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 KATNAL1Q9BW62 490 aa8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 PREBQ9HCU5 417 aa8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 HPSEQ9Y251 543 aa8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 L3MBTL1Q9Y468 752 aa8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 INPPL1O15357 1258 aa8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 MFAP3LO75121 409 aa8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 PARNO95453 639 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 BMP15O95972 392 aa8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 MYO1EQ12965 1108 aa8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 RNF180Q86T96 592 aa8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 SERINC5Q86VE9 423 aa8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 CYFIP2Q96F07 1278 aa8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 ZWILCHQ9H900 591 aa8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 TUFT1Q9NNX1 390 aa8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 SAR1BQ9Y6B6 198 aa8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 MYH11P35749 1972 aa8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 HSF2BPO75031 334 aa8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 PPP6R2O75170 966 aa8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 PBX1P40424 430 aa8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 MDH1P40925 334 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 ATP1A2P50993 1020 aa8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 FOSBP53539 338 aa8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 GUCY1A3Q02108 690 aa8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 GRM1Q13255 1194 aa8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 PTK7Q13308 1070 aa8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 NNTQ13423 1086 aa8.28□□□□□ -1.08
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USP4-211ENST00000485450 DGKDQ16760 1214 aa8.28□□□□□ -1.08
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USP4-211ENST00000485450 PPFIBP1Q86W92 1011 aa8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 PALB2Q86YC2 1186 aa8.28□□□□□ -1.08
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USP4-211ENST00000485450 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 TAF4BQ92750 862 aa8.28□□□□□ -1.08
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USP4-211ENST00000485450 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.28□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 DPPA5A6NC42 116 aa8.28□□□□□ -1.08
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USP4-211ENST00000485450 CAVIN3Q969G5 261 aa8.28□□□□□ -1.08
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USP4-211ENST00000485450 RUFY1Q96T51 708 aa8.28□□□□□ -1.08
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USP4-211ENST00000485450 TIMM22Q9Y584 194 aa8.28□□□□□ -1.08
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USP4-211ENST00000485450 SEC24CP53992 1094 aa8.27□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 RTP1P59025 263 aa8.27□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 BPIFB4P59827 614 aa8.27□□□□□ -1.09
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USP4-211ENST00000485450 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa8.27□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 PAPLNO95428 1278 aa8.27□□□□□ -1.09
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