RNA–Protein interactions for RNA: tW(UCA)Q

tW(UCA)Q, Transcript of Mitochondrial tRNA, annotated as tryptophanyl tRNA (tRNA-Trp), yeastyeast

Gene tW(UCA)Q, Length 74 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(UCA)QtW(UCA)Q SUA5P32579 426 aa0.53□□□□□ -2.32
tW(UCA)QtW(UCA)Q ADH5P38113 351 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
tW(UCA)QtW(UCA)Q DOG1P38774 246 aa0.53□□□□□ -2.32
tW(UCA)QtW(UCA)Q VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data0.53□□□□□ -2.32not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q JEM1P40358 645 aa0.53□□□□□ -2.32
tW(UCA)QtW(UCA)Q GDS1P41913 522 aa0.53□□□□□ -2.32
tW(UCA)QtW(UCA)Q AAH1P53909 347 aa0.53□□□□□ -2.32
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q POX1P13711 748 aa0.52□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q FPR1P20081 114 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q SCL1P21243 252 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q RXT2P38255 430 aa0.52□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q NIF3P53081 288 aa0.52□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q DBP9Q06218 594 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q ARN2P38724 620 aa0.51□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q GLE2P40066 365 aa0.51□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q AGX1P43567 385 aa0.51□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q DPP1Q05521 289 aa0.51□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q SAM4Q08985 325 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q GEP5Q12393 293 aa0.51□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q RAS2P01120 322 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q PEX4P29340 183 aa0.5□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPS0AP32905 252 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q YKL162CP36052 402 aa0.5□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q HMT1P38074 348 aa0.5□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q LIN1P38852 340 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q BMT5P40493 336 aa0.5□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q TRM44Q02648 567 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR209CQ03648 457 aa0.5□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q TAF9Q05027 157 aa0.5□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q APC9Q12107 265 aa0.5□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOR114WQ12219 294 aa0.5□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR316C-AI2HB70 103 aa0.49□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q YER188C-AP0C0V2 99 aa0.49□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q MSS116P15424 664 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q VMA2P16140 517 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q CAM1P29547 415 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q SHC1P39000 512 aa0.49□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q OST2P46964 130 aa0.49□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q ERG25P53045 309 aa0.49□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPL077CQ02831 240 aa0.49□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q TAZ1Q06510 381 aa0.49□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q PBP4Q07362 185 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q RIO1Q12196 484 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q FRE6Q12473 712 aa0.49□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q UBR2Q07963 1872 aa0.48□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPS3P05750 240 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q DSF1P0CX08 502 aa0.48□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNR073CP0CX09 502 aa0.48□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q YKL063CP35725 167 aa0.48□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q KDX1P36005 433 aa0.48□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q AVT2P39981 480 aa0.48□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q COX16P47081 118 aa0.48□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q MDM34P53083 459 aa0.48□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q CUE3P53137 624 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q FMP41P53889 259 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q BUD25P85052 153 aa0.48□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q SDC1Q03323 175 aa0.48□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q VPS60Q03390 229 aa0.48□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q PEX10Q05568 337 aa0.48□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data0.48□□□□□ -2.33not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q PST1Q12355 444 aa0.48□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q GAL3P13045 520 aa0.47□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPC37P36121 282 aa0.47□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q YBR219CP38317 127 aa0.47□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL13BP40212 199 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q PET494P07390 489 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q COS2P0CX12 379 aa0.46□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q COS3P0CX13 379 aa0.46□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data0.46□□□□□ -2.34not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPT4P32914 102 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q MAL32P38158 584 aa0.46□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q SIF2P38262 535 aa0.46□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q NPT1P39683 429 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q PRM10P42946 383 aa0.46□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q YJL028WP47062 111 aa0.46□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q GTO1P48239 356 aa0.46□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q MAL12P53341 584 aa0.46□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q DBP6P53734 629 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRPS8Q03799 155 aa0.46□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q BOP2Q06150 570 aa0.46□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q YAL064W-BO13512 126 aa0.45□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q VAR1P02381 398 aa0.45□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q CPA1P07258 411 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q DDI2P0CH63 225 aa0.45□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q DDI3P0CH64 225 aa0.45□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q UPS2P35200 230 aa0.45□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q SWD2P36104 329 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q LAS1P36146 502 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q PHO88P38264 188 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q YJR079WP47126 109 aa0.45□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNL050CP53952 270 aa0.45□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q RSM10Q03201 203 aa0.45□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q CSI2Q08054 341 aa0.45□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATP6P00854 259 aa0.44□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q ECM13P38195 257 aa0.44□□□□□ -2.34
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