RNA–Protein interactions for RNA: YLL013C

PUF3, Transcript of Protein of the mitochondrial outer surface, yeast

Gene PUF3, Length 2,640 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUF3	YLL013C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	MET3	P08536	511 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	NDC1	P32500	655 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	ECT1	P33412	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	SAM50	P53969	484 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	VCX1	Q99385	411 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
PUF3	YLL013C	HNM1	P19807	563 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	MSS4	P38994	779 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	NCA3	P46955	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	CIK1	Q01649	594 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	MSS11	Q03825	758 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	GMC1	Q04399	608 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	RTR2	Q12378	196 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	REP1	P03871	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	PDE2	P06776	526 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	MCH2	P36032	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	SDS22	P36047	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	FRM2	P37261	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	SHE1	P38200	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YLF2	P38746	405 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YIR020C	P40575	100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YLR346C	Q06139	101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YBR285W	P38354	144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	PUG1	P40100	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	CTK2	P46962	323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	SLD3	P53135	668 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YNL046W	P53956	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	MSI1	P13712	422 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	TAT1	P38085	619 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	FAT1	P38225	669 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	FMC1	P40491	155 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	PPT1	P53043	513 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	MTL1	P53214	551 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YNR048W	P53740	393 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	GAL83	Q04739	417 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	ECM4	P36156	370 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	ATF1	P40353	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	CCC1	P47818	322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	NRK1	P53915	240 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	YDC1	Q02896	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	ENA1	P13587	1091 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	TYW3	P53177	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	PEF1	P53238	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	AAH1	P53909	347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	TLG1	Q03322	224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	YLR173W	Q06247	608 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	SNA4	Q07549	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	FRE8	Q12209	686 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	SOD2	P00447	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	RPL39	P04650	51 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	DLS1	P40366	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	BNA2	P47125	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	ABM1	P47146	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	CSI2	Q08054	341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	MSS2	P40990	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	YHC3	P47040	408 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	GSH2	Q08220	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
PUF3	YLL013C	THI2	P38141	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	SLI1	P53304	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	YLR152C	P54072	576 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	RNH1	Q04740	348 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	YPR098C	Q06089	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	SSK1	Q07084	712 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	ISA2	Q12425	185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	ERP4	Q12450	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	YPR1	Q12458	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUF3	YLL013C	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.5 ms