RNA–Protein interactions for RNA: YJL192C

SOP4, Transcript of ER-membrane protein, yeast

Gene SOP4, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOP4	YJL192C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	MRPL15	P36523	253 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	SCO2	P38072	301 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	YPT10	P38146	199 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	LDB7	P38210	180 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	BMT2	P38278	337 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	EFM1	P38732	585 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	PAU15	P40585	124 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	MEP2	P41948	499 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	IDS2	P46958	469 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	TIS11	P47977	285 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	SOL1	P50278	321 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	RSM27	P53305	110 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	ATC1	Q04005	294 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	CDD1	Q06549	142 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	IPK1	Q06667	281 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	LDB18	Q07887	179 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	SCP1	Q08873	200 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	ATX2	Q12067	313 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	PER33	Q12144	273 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	INP53	Q12271	1107 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	YLR118C	Q12354	227 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	ARP7	Q12406	477 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	COA6	Q3E846	104 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	SEC59	P20048	519 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	YIM1	P28625	365 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	ATS1	P31386	333 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	SEC17	P32602	292 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	SSS1	P35179	80 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	MRPL36	P36531	177 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	PAU24	P38155	120 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	SHE1	P38200	338 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	REG2	P38232	338 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	POP7	P38291	140 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	SHG1	P38337	142 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	SUR2	P38992	349 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	ACA1	P39970	489 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	QRI7	P43122	407 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	YJR149W	P47177	404 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	SCS3	P53012	380 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	YGL185C	P53100	379 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	PAU12	P53343	120 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	GPI15	P53961	229 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	GIP3	Q03016	1276 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	SNO1	Q03144	224 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	RSM10	Q03201	203 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	SPC19	Q03954	165 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	SWF1	Q04629	336 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	HRD3	Q05787	833 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	VID22	Q05934	901 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	EAF3	Q12432	401 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	AHC1	Q12433	566 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	PCL9	Q12477	304 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	CCH1	P50077	2039 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	SCEI	P03882	235 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	ATP5	P09457	212 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	RER1	P25560	188 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	PBN1	P25580	416 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	MRP20	P32387	263 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	YEF1	P32622	495 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	SRO77	P38163	1010 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	BNA4	P38169	460 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	YBR013C	P38215	129 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	YJL193W	P39542	402 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	ALG8	P40351	577 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	LAS21	P40367	830 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	HXT14	P42833	540 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	SNO3	P43544	222 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	AAH1	P53909	347 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	APJ1	P53940	528 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SOP4	YJL192C	OAZ1	Q02803	292 aa		3.46	□□□□□ -1.86

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