RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	ROT2	P38138	954 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YHR035W	P38769	630 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PFS1	P38872	237 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PHO90	P39535	881 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	COG3	P40094	801 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PAN6	P40459	309 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	GDS1	P41913	522 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	TRM9	P49957	279 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YGL159W	P53110	370 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	RPN14	P53196	417 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	TIM21	P53220	239 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YGR127W	P53275	312 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YDR366C	P87287	132 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	EKI1	Q03764	534 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SHH3	Q04487	196 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	AIM32	Q04689	311 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	GTO3	Q04806	366 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YDR222W	Q04925	415 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YML053C	Q04978	212 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PEX30	Q06169	523 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	GPI11	Q06636	219 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	RRT8	Q08219	342 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SRL2	Q12020	392 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	VAM3	Q12241	283 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	NYV1	Q12255	253 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	TPO4	Q12256	659 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	RKM5	Q12367	367 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	TFC7	Q12415	435 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	MHT1	Q12525	324 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	FSH3	Q99369	266 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YOR304C-A	O14468	76 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	UNG1	P12887	359 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	ZRC1	P20107	442 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PET18	P25362	215 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YCR102C	P25608	368 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SUA5	P32579	426 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YEF1	P32622	495 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	MNS1	P32906	549 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YOX1	P34161	385 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SKT5	P34226	696 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	MRPL28	P36527	147 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	RIB1	P38066	345 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	ATG12	P38316	186 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YBR220C	P38318	560 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	GPI16	P38875	610 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	FAD1	P38913	306 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	ALP1	P38971	573 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	BMT5	P40493	336 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	LCB2	P40970	561 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SSU1	P41930	458 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YAR1	P46683	200 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	DAN1	P47178	298 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	AVT4	P50944	713 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	COS10	P52924	374 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	NRK1	P53915	240 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	EOS1	P53938	366 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	CTF19	Q02732	369 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	STD1	Q02794	444 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YPL080C	Q02826	108 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YMR209C	Q03648	457 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PIN3	Q06449	215 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	ANT1	Q06497	328 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	ENT4	Q07872	247 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YOL131W	Q08270	108 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YOL159C	Q08300	171 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	MMT2	Q08970	484 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SRO7	Q12038	1033 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	CRC1	Q12289	327 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PRM4	Q12498	284 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	MHF2	Q3E829	80 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	QCR2	P07257	368 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	MSF1	P08425	469 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	STE50	P25344	346 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PBN1	P25580	416 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	AFG1	P32317	509 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	RML2	P32611	393 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SFC1	P33303	322 aa		3.09	□□□□□ -1.91

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