RNA–Protein interactions for RNA: YPR057W

BRR1, Transcript of snRNP protein component of spliceosomal snRNPs, yeastyeast

Gene BRR1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRR1YPR057W SSK1Q07084 712 aa8.39□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W MIM1Q08176 113 aa8.39□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W RDL2Q08742 149 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W YLR125WQ12138 136 aa8.39□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W SCM3Q12334 223 aa8.39□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W SWM1Q12379 170 aa8.39□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W YOR032W-AQ8TGS1 66 aa8.39□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W ITR1P30605 584 aa8.38□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W PRE4P30657 266 aa8.38□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W ERG24P32462 438 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W HTD2P38790 280 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W SLS1P42900 643 aa8.38□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W LYS20P48570 428 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W YGR126WP53274 230 aa8.38□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W MRPL13Q02204 264 aa8.38□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W GIS1Q03833 894 aa8.38□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W YMR130WQ04223 302 aa8.38□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W AGE1Q04412 482 aa8.38□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W MRX8Q05473 314 aa8.38□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W LYS21Q12122 440 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W HSP42Q12329 375 aa8.38□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W YHR214C-DP0CX93 97 aa8.37□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W PDA1P16387 420 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W YCR102CP25608 368 aa8.37□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W ATS1P31386 333 aa8.37□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W THI4P32318 326 aa8.37□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W OM14P38325 134 aa8.37□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data8.37□□□□□ -1.07not detected
BRR1YPR057W YPL039WQ03080 316 aa8.37□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W PEX30Q06169 523 aa8.37□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W YAL064W-BO13512 126 aa8.36□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W STE18P18852 110 aa8.36□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W ERG9P29704 444 aa8.36□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W RPC34P32910 317 aa8.36□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W PDR3P33200 976 aa8.36□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W CLG1P35190 452 aa8.36□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W SPT10P35208 640 aa8.36□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W YBR242WP38331 238 aa8.36□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W BOL3P39724 118 aa8.36□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W DIE2P50076 525 aa8.36□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W NUP53Q03790 475 aa8.36□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W RAX1Q08760 435 aa8.36□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W GRE1Q08969 168 aa8.36□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W ENV7Q12003 364 aa8.36□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W RTC5Q12108 567 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W TY1A-BLQ12266 440 aa8.36□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W INP53Q12271 1107 aa8.36□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W HMS1Q12398 434 aa8.36□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W ERG8P24521 451 aa8.35□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W PUP1P25043 261 aa8.35□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W CNE1P27825 502 aa8.35□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W PPQ1P32945 549 aa8.35□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W LEU5P38702 357 aa8.35□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W SHO1P40073 367 aa8.35□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W AAD14P42884 376 aa8.35□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W NIT2P47016 307 aa8.35□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W RMD9P53140 646 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W MTM1P53320 366 aa8.35□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W MRPS16Q02608 121 aa8.35□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W AIM36Q03798 255 aa8.35□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W VBA4Q04602 768 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W NNT1Q05874 261 aa8.35□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W ASR1Q06834 288 aa8.35□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W NIP7Q08962 181 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W MSW1P04803 379 aa8.34□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W RIP1P08067 215 aa8.34□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W SPS2P08459 502 aa8.34□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W MATALPHA1P0CY06 175 aa8.34□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W HMLALPHA1P0CY07 175 aa8.34□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W ERG4P25340 473 aa8.34□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W ATG22P25568 528 aa8.34□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W CAM1P29547 415 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W MCM10P32354 571 aa8.34□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W COS9P36034 407 aa8.34□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W RFC4P40339 323 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W REE1P40893 198 aa8.34□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W YLR152CP54072 576 aa8.34□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W PET191Q02772 108 aa8.34□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W KEI1Q06346 221 aa8.34□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W MCH4Q08268 501 aa8.34□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W MTR10Q99189 972 aa8.34□□□□□ -1.07
BRR1YPR057W CTA1P15202 515 aa8.33□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W MEK1P24719 497 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W KRR1P25586 316 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W RNP1P32385 249 aa8.33□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W SMB1P40018 196 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W ASI3P53983 676 aa8.33□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W SDC1Q03323 175 aa8.33□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W MIX14Q04341 121 aa8.33□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W MDM32Q12171 622 aa8.33□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data8.33□□□□□ -1.08not detected
BRR1YPR057W YHR214C-EQ8TGK0 99 aa8.33□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W RPL6BP05739 176 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W PDX1P16451 410 aa8.32□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W MKS1P34072 584 aa8.32□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W UTP30P36144 274 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W YHR122WP38829 231 aa8.32□□□□□ -1.08
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