RNA–Protein interactions for RNA: YMR228W

MTF1, Transcript of Mitochondrial RNA polymerase specificity factor, yeast

Gene MTF1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTF1	YMR228W	COS10	P52924	374 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	WSC2	P53832	503 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	SNX41	Q04053	625 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	NKP2	Q06162	153 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	ESA1	Q08649	445 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	GIS3	Q12418	502 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	NUM1	Q00402	2748 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	CYC3	P06182	269 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	NAM2	P11325	894 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	MRPL25	P23369	157 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	AIM29	P36154	155 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	DDI1	P40087	428 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	CIN2	P46670	268 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	TAD2	P47058	250 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	MST27	P53176	234 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	CPD1	P53314	239 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	TRM82	Q03774	444 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	TMS1	Q12116	473 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	REP1	P03871	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	OST6	Q03723	332 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	KRE28	Q04431	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	SRL1	Q08673	210 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	RPN6	Q12377	434 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	QCR6	P00127	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	ERD1	P16151	362 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	CPR4	P25334	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	PPA2	P28239	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	CSE1	P33307	960 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	SDH3	P33421	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	BNA7	Q04066	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	HNT3	Q08702	217 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	MSH5	Q12175	901 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	FRE8	Q12209	686 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	DEP1	P31385	405 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	MCH2	P36032	473 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	LDB7	P38210	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	RCK2	P38623	610 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	SNM1	P40993	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	GDS1	P41913	522 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	TIS11	P47977	285 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	CLD1	P53264	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	MTM1	P53320	366 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	VBA1	Q04301	562 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	PRM4	Q12498	284 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	TEL1	P38110	2787 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	IRA2	P19158	3079 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	MSI1	P13712	422 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	CBS2	P14905	389 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	RPB5	P20434	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	PDC2	P32896	925 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	MAL32	P38158	584 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	YHL026C	P38740	315 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	IDP2	P41939	412 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	HIT1	P46973	164 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	UBC13	P52490	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	SHY1	P53266	389 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	MAL12	P53341	584 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
MTF1	YMR228W	KTR6	P54070	446 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	RIF2	Q06208	395 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTF1	YMR228W	JIP3	O13555	125 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	REV1	P12689	985 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	TFS1	P14306	219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	CPR3	P25719	182 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	INO2	P26798	304 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	IES6	P32617	166 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	MRPL6	P32904	214 aa		4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.1 ms