RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL050CYKL050C TRS23Q03784 219 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C RAD34Q06665 692 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C MLH3Q12083 715 aa3.34□□□□□ -1.87
YKL050CYKL050C ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C PET54P10834 293 aa3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C NHP6AP11632 93 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C STE4P18851 423 aa3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C CLB2P24869 491 aa3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C CDC10P25342 322 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C KAR4P25583 335 aa3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C TOA2P32774 122 aa3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C TIP20P33891 701 aa3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YBR056WP38081 501 aa3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YBR053CP38235 358 aa3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C ARP1P38696 384 aa3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C PHO90P39535 881 aa3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C UFE1P41834 346 aa3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YJL016WP47072 561 aa3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YJR012CP47087 207 aa3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C NBP1P52919 319 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C BRR6P53062 197 aa3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YGR035CP53222 116 aa3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C SMM1P53720 384 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C CTR3Q06686 241 aa3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C ENB1Q08299 606 aa3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C RGT2Q12300 763 aa3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C ARP6Q12509 438 aa3.34□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C CAM1P29547 415 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data3.33□□□□□ -1.88not detected
YKL050CYKL050C ELM1P32801 640 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C ROT2P38138 954 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C BDH1P39714 382 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YAT2P40017 923 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C HMS2P47175 358 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C NUP57P48837 541 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C TOS2P50078 622 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C COS6P53344 381 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C ASI1P54074 624 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C ERG5P54781 538 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C DIG1Q03063 452 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C ORM2Q06144 216 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C USV1Q12132 391 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YCT1Q12235 531 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YKL187CP34231 750 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C UTP11P34247 250 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C SHE3P38272 425 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C EDC3P39998 551 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C KEG1P43614 200 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C JAC1P53193 184 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C NMA2P53204 395 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C BUD32P53323 261 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C FYV6P53913 173 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C NRK1P53915 240 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YNL095CP53932 642 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C HRD3Q05787 833 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C RFU1Q08003 200 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C FCY22Q12119 530 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YDR018CQ12185 396 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C BBP1Q12365 385 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C SUC2P00724 532 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C CPT1P17898 393 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C HCM1P25364 564 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C MRPL9P31334 269 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C MUD1P32605 298 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C SMB1P40018 196 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C COG3P40094 801 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C MDV1P47025 714 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C IRC18P47056 224 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C CCC1P47818 322 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C GOR1P53839 350 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C ASI3P53983 676 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C HEM25Q07534 307 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YLR031WQ07978 186 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C HNT3Q08702 217 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C CCH1P50077 2039 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C AIM17P23180 465 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C POF1P25576 258 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C HOM6P31116 359 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C MKK1P32490 508 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C SGE1P33335 543 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C HIS7P33734 552 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YCR087C-AP37263 153 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C ECM13P38195 257 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YBP1P38315 674 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C FAU1P40099 211 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C BCH1Q05029 724 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C HCR1Q05775 265 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C ICT1Q12385 394 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YOP1Q12402 180 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C AHA1Q12449 350 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C BAR1P12630 587 aa3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.4 ms