RNA–Protein interactions for RNA: YHR195W

NVJ1, Transcript of Nuclear envelope protein, yeast

Gene NVJ1, Length 966 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NVJ1	YHR195W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
NVJ1	YHR195W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NVJ1	YHR195W	ERV2	Q12284	196 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NVJ1	YHR195W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
NVJ1	YHR195W	EMP46	Q12396	444 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NVJ1	YHR195W	PET20	Q99373	253 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NVJ1	YHR195W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	RPO26	P20435	155 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	MXR2	P25566	168 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	ITR2	P30606	609 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	TAF14	P35189	244 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	ECM8	P38246	354 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YKE4	P40544	346 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	MEP2	P41948	499 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	APS3	P47064	194 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	AIM24	P47127	394 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	BIO4	P53630	237 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YNL140C	P53910	189 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	MTQ1	P53944	314 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	SED5	Q01590	340 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YDC1	Q02896	317 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	IRC4	Q03036	179 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	TDA1	Q03533	586 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	PRM6	Q04705	352 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	GRE1	Q08969	168 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	JLP1	Q12358	412 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	TAF2	P23255	1407 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	PUT1	P09368	476 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	MRPS5	P33759	307 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	MRX3	P38172	270 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	DER1	P38307	211 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	ATG7	P38862	630 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	SEN34	P39707	275 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YJL016W	P47072	561 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	SCS3	P53012	380 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	USE1	P53146	245 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	OST6	Q03723	332 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	NAT4	Q04751	285 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	PLB3	Q08108	686 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YPL150W	Q12152	901 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	PCL9	Q12477	304 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	CPR3	P25719	182 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YKL063C	P35725	167 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	MCH2	P36032	473 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YKL162C	P36052	402 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	UFE1	P41834	346 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	CIN2	P46670	268 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	HOC1	P47124	396 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	CCC1	P47818	322 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YGL235W	P53071	178 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	GTR2	P53290	341 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	MKC7	P53379	596 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	FYV6	P53913	173 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YLR460C	P54007	376 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	TMS1	Q12116	473 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	MDS3	P53094	1487 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	ATP6	P00854	259 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	CBS2	P14905	389 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	CYC2	P38909	366 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	MAM33	P40513	266 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	IZH4	Q99393	312 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	PHO2	P07269	559 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	TCA17	P32613	152 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	ZRT1	P32804	376 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	RBG1	P39729	369 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	YIA6	P40556	373 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	HAC1	P41546	238 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NVJ1	YHR195W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.3 ms