RNA–Protein interactions for RNA: YGR089W

NNF2, Transcript of Protein that exhibits physical and genetic interactions with Rpb8p, yeast

Gene NNF2, Length 2,811 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NNF2	YGR089W	YIL012W	P40551	113 aa		0.31	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	YMR166C	Q03829	368 aa		0.31	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	UBX2	Q04228	584 aa		0.31	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	CTS2	Q06350	511 aa		0.31	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	VIK1	Q12045	647 aa		0.31	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	0.31	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	SKS1	Q12505	502 aa		0.31	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	RGS2	Q99188	309 aa		0.31	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	ERD1	P16151	362 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	DAD2	P36162	133 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	POP2	P39008	433 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	FCY21	P40039	528 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	LIF1	P53150	421 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	AQR1	P53943	586 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	DCR2	Q05924	578 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	YPL278C	Q08990	100 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	AGC1	Q12482	902 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	MRPL6	P32904	214 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	RXT2	P38255	430 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	JEM1	P40358	645 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	YFL064C	P43540	174 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	TPN1	P53099	579 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	BIO4	P53630	237 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	SUE1	Q06524	206 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	FRE6	Q12473	712 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	LAG2	Q92325	660 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	GAL7	P08431	366 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	SCO1	P23833	295 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	ACB1	P31787	87 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	COY1	P34237	679 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	OST3	P48439	350 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	YNL146W	P53906	100 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	EOS1	P53938	366 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	SNX41	Q04053	625 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	NNT1	Q05874	261 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	BUR2	Q05949	395 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	YLR446W	Q06204	433 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	TY3A-G	Q12173	290 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	YDR262W	Q12331	272 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	ATG5	Q12380	294 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	TY3A-I	Q99219	290 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	RRT12	P25381	491 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	TPO5	P36029	618 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	MCH2	P36032	473 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	MRPL3	P36516	390 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	YPC1	P38298	316 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	PES4	P39684	611 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	AVT6	P40074	448 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	YGL114W	P53134	725 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	RSM27	P53305	110 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	IRC4	Q03036	179 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	TVP15	Q03860	143 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	YDL144C	Q07589	356 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	YOR268C	Q08734	132 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	IMP1	P28627	190 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	YKL162C	P36052	402 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	MBA1	P38300	278 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.28	□□□□□ -2.36	not detected
NNF2	YGR089W	YHR035W	P38769	630 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	SPL2	P38839	148 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	SUR2	P38992	349 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	VAB2	P40003	282 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	YFR054C	P43622	192 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	MND1	P53102	219 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	YGR168C	P53293	376 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	CAB4	P53332	305 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	SLM2	P53955	656 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	UFD4	P33202	1483 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	TFS1	P14306	219 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	IFM1	P25038	676 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.28	□□□□□ -2.36	not detected
NNF2	YGR089W	ZRT1	P32804	376 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	SIF2	P38262	535 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.36

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