RNA–Protein interactions for RNA: YFL039C

ACT1, Transcript of Actin, yeast

Gene ACT1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ACT1	YFL039C	BRR6	P53062	197 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	MMS2	P53152	137 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	RSM23	Q01163	450 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	NUP100	Q02629	959 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	YPL080C	Q02826	108 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	HSP31	Q04432	237 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	FMP42	Q04991	504 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	MHR1	Q06630	226 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	SSK1	Q07084	712 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	LDS2	Q08218	356 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	THP1	Q08231	455 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	HNT3	Q08702	217 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	IES3	Q12345	250 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	OPI3	P05375	206 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	SPT3	P06844	337 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	CPR4	P25334	318 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	YCR102C	P25608	368 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	JEN1	P36035	616 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.22	□□□□□ -1.73	RIP-Chip
ACT1	YFL039C	GOS1	P38736	223 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	WSC4	P38739	605 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	COG3	P40094	801 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	FMP32	P43557	207 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	GUF1	P46943	645 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	YJR079W	P47126	109 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	NUP57	P48837	541 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	CPD1	P53314	239 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	SOL4	P53315	255 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	ARL3	Q02804	198 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	CSN9	Q03981	162 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	VBA1	Q04301	562 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	YPR091C	Q06833	770 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	YLR036C	Q07986	203 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACT1	YFL039C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	HIS3	P06633	220 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	SEC22	P22214	214 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	DCC1	P25559	380 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	SKN1	P33336	771 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	SPC34	P36131	295 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	CBP4	P37267	147 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	FMP23	P38231	175 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	YBR242W	P38331	238 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	ANS1	P38832	159 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	IRC18	P47056	224 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	TIS11	P47977	285 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	AIM34	Q03673	198 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	NEJ1	Q06148	342 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	POM33	Q12164	279 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	ATG34	Q12292	412 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	RDI1	Q12434	202 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	YOR1	P53049	1477 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	CSG2	P35206	410 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	EFM1	P38732	585 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	YAL037W	P39728	267 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	FCY21	P40039	528 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	YER186C	P40101	306 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	SYG1	P40528	902 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	CWC27	Q02770	301 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	MAK3	Q03503	176 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	HER2	Q03557	464 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	DML1	Q03652	475 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	RUB1	Q03919	77 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	GLO2	Q05584	274 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	YDL057W	Q07379	328 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	NDD1	Q08887	554 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	BSC1	Q12140	328 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	YLL056C	Q12177	298 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.2	□□□□□ -1.74	not detected
ACT1	YFL039C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	YCT1	Q12235	531 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
ACT1	YFL039C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74

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