RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 MICAL3Q7RTP6 2002 aa18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 RHOBTB3O94955 611 aa18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 SMC2O95347 1197 aa18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 GJB5O95377 273 aa18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 PNOCQ13519 176 aa18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 SPATA20Q8TB22 786 aa18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 PDZD7Q9H5P4 517 aa18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 PTPRHQ9HD43 1115 aa18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa18.06■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 TOM1L1O75674 476 aa18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 MYBP10242 640 aa18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 PROZP22891 400 aa18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 MCM4P33991 863 aa18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 CASP5P51878 434 aa18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM132AQ24JP5 1023 aa18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF507Q8TCN5 953 aa18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 HPS3Q969F9 1004 aa18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 GSDMAQ96QA5 445 aa18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 ACCSQ96QU6 501 aa18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 ADPGKQ9BRR6 497 aa18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM206Q9H813 350 aa18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 LRFN2Q9ULH4 789 aa18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 EXOC7Q9UPT5 735 aa18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 USP20Q9Y2K6 914 aa18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa18.05■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 EEF1DP3Q658K8 133 aa18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 PGBD4Q96DM1 585 aa18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 RAD9AQ99638 391 aa18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC39A2Q9NP94 309 aa18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 RMND1Q9NWS8 449 aa18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 TTC3P53804 2025 aa18.04■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 UBE4BO95155 1302 aa18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 ABLIM1O14639 778 aa18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 HOXA2O43364 376 aa18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 UPP2O95045 317 aa18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 NPTXRO95502 500 aa18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 MCF2P10911 925 aa18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 LIG4P49917 911 aa18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 STK4Q13043 487 aa18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 BMT2Q1RMZ1 405 aa18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 MPZL3Q6UWV2 235 aa18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 HACE1Q8IYU2 909 aa18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 GLIS3Q8NEA6 775 aa18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 RSPH1Q8WYR4 309 aa18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 SMARCE1Q969G3 411 aa18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 BICD1Q96G01 975 aa18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 ZBED2Q9BTP6 218 aa18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 IPPQ9Y573 584 aa18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa18.03■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 GRXCR1A8MXD5 290 aa18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 DGKIO75912 1065 aa18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 MBD3O95983 291 aa18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 MCL1Q07820 350 aa18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 KCNA1Q09470 495 aa18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 RAB30Q15771 203 aa18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 SLFN12LQ6IEE8 588 aa18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 KIAA0895Q8NCT3 520 aa18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 GPT2Q8TD30 523 aa18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 SCFD1Q8WVM8 642 aa18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 TCHPQ9BT92 498 aa18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 CDT1Q9H211 546 aa18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 CLSTN2Q9H4D0 955 aa18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 UBN1Q9NPG3 1134 aa18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 INSL6Q9Y581 213 aa18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 STYXL1Q9Y6J8 313 aa18.02■□□□□ 0.48
PACSIN3-210ENST00000533686 CLDN3O15551 220 aa18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3-210ENST00000533686 TLL1O43897 1013 aa18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3-210ENST00000533686 KIF20AO95235 890 aa18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3-210ENST00000533686 ITGA4P13612 1032 aa18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF568Q3ZCX4 644 aa18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM117BQ6P1L5 589 aa18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3-210ENST00000533686 SYCP3Q8IZU3 236 aa18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3-210ENST00000533686 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3-210ENST00000533686 RNF19AQ9NV58 838 aa18.01■□□□□ 0.47
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